| RefSeq | NZ_CP009514.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010285 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1586 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2648 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4165275..619 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
GATTTAACTCCATTTTTTAGCAAAAGCCTATTTTTTAATCAATTTCGTTTTTAATTAAACTCGTTCTTAACCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATATTTTTAATTAAACTCGTTTTCAATCAAACATTATGTCTTATGAATTGCGTTTCATAAATTGCGTTTTATGAGTCACATTCTCATTTATCGCTTCTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATTTATCGCTTTTCATTTATCGCTTCTCGTGTATCGCTTCTCATGTATTGCATCTTCATGCACATTTATACTATAGCTGTAGATCAGTATCTCTACAGTTTTATAATACTGTCTTGTCATCAGGGATTAAAAGCAGTTCGTTTTACTTCGGAAATTAAATAAGTTATTTTAAGATTATTATTCAATTCATTCTTTTGAATAATTTCTCTGATGAAATATAACATTAAAGACTACAGTAAAAATTACTGAATTATTAACTTCAAATTACTGAGTTAATAACTTCAAAAATCTATTTTTAGAATAAATATTTGGAAAATAAATACTTGAAAATAGAGTGTCTTAAATAAAAATTAATAAGTTAATACGTATACATATAAATTTTTTTGATTATTTATACTTTTTATATATGTTTAGTTTCAGGTTATATTGCTTTTTTCTTCCTAACTGTTTTTTATTTATTATTAATTTTTTTCTTTTCTTAATTGTTATTCGTATCAAGACTGTTTTCATTTTTAATACAACCACTTTCGTTTCGATTCAGGAACCTGTTTACTTCAATTATTATTTATTTATAAATATTTTTTATCATTCAATGGAAATAAAGGGGTTTGAAAACCCTTTATCTTCCTCCACGCGAAAAAGAGGATTTAAATCTTGACTTCAAAAATTACAAAATTTTTGATTTTTTATTTTATTTTCACATGCTCTATTGATATTGATTTTTTTGTATAATATTTAAGGCAAATAACTGTTCCAGTGGAAACAAAGGGGTCTTTACCATAACTATTAATACCGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATGTGAACTGAAATTGGATGCTTATATACAAATTTTAGCTAAAATTTTAGCTAAAGAATGTTCCGAATACACATTCAATCAGGGATTAAGAGATACTTTAAAGTGCGCAACTGACTTTTCAGCGTGTTATTAGTATCCCTTGAATAAAAATTTCAGGCATTAACTTTAAGAAACATGCATTTGTCTATCCATTCTTCCCCTGTGAATCTATTATTATTTATGTTCACTTATTAAGGTTATACAAAAATAATATTTTGGGATTTCAGAATTTCCAGAAACTGAGAATAAAAAACACTTTAAAAAATAGCAGTTAAACCTTCCCAAATATCTTTGCTATGTAGAGTTTAACTATGCAGTATTTGAAGTGAGAAGAGAAAAACATTCTTTAGACCGTATTTTCTTAAACGGCTTATTTACTTTGCATTAATAACTCTGCATATTATGTCAGCTATATGTTAGGCTATCCTAACCCGTTAAATCCAGATATTATAACAAATCCATGATATTATAACTTTTATTAAGAGGGTCATT
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif TATCGCTTCTC
Motif TTTWATTAAACTSGTTTTYAAYCAARCAT
Motif SHTYCAVTSGAAAHAAAGGRK
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|