RefSeq NZ_CP009520.1
DoriC accession number aORI10010381
OriC length 1421 nt
OriC AT content 0.2773
The location of oriC region 4504582..250 nt
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OriC map
OriC sequences
GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATACAACTGCTAAATTACCAAGTACCTCTCCTAACAACAGGACAAGGAAGTATCCAAAATCTAAAAAAAAGAATTAGGACTTACGCAGTTGAACTGAAAAATCAACAGCATCGAACCGTTAACTGTTTAAAACGTAACTTTAATCCACAGTTTTTGTCGTAATTGATTTTGTTCCTCAAGTGCGTAAGTCCTAAGAATGTATGTTAAGATATCATAATAATGTCTGCTTAAGAGGGAGACCCCTATATTTCGAGTGGAGAGATTTTTGTAGGTATAGAAATGTGAATTTATCAGAACATATAGCTTAGATTTATTAGTTTTTTGAAAACGCACATAAAATTCTTCTAATCACAAGCACAAAGAAATGAAAGTACTTAAAAGAACTTTCATGCTAAACAATATTTTTTCTGATAGATCAGGTCATCAGTACAATGAATATATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATGAATACATATAATCAGTTTTTTCTCTATTGTATAAAACTTCTCCAAAAACAAACTAGCCTTTTTAATAATAAATTATATATAGTATTAACTCTATAACTAAACAACATTATTTTACTGATAAGCAAATAAAATCTTATTTTATTTTGCTGCCTAGAACTTCCAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGGGTTATATAAACGTTCCAGTGGAAATTAGGGGGTCTACCCTATTTTTTACTCTTTTCTTTGTTTATCTTTCTTTGATTTCCTTAACTTTCTTAACTTTCTTTAATTTCCTAGCTTTTTTATTTTCTTTATCTTTTTCTTACTTTTTCAATGCAAATAATTCTGAGTTTTAAAATTTATCTAAAGTTTTCTATTTTCTAAACTCTGTAAACCCTTTTATTCACAGGTGATTTGATTTACATGATTCTAATTTTATCTCAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATATAAAAATATTCTAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGGAAGGGTTTAAATTCAACCTCCATTGATTCTGGAATTCATAATTTTTTGTTTCAGCTATAATAAGTTATATAACGTTGGTTTTTATGGTAGATATTTAAGGTATAAAATATTTCCAGTGGAAATCAGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATATAGCTTAAATTCACTTGTTTATAAACCAATTTCACCTAAAATTTCAACAAAAGAAGATATGGAATATAGATTTTATCTGGTAGGCGAGGTATCTTAATACTTAAAACTCGCCCGCCATTTTATCATTAGCTAGTAGAAAATAAGGGTTTCAGGCATTAA
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GTGGATAAAGTAAAACCAGTTTTATTTAAAATACTTATGGAATACAACTGCTAAATTACCAAGTACCTCTCCTAACAACAGGACAAGGAAGTATCCAAAATCTAAAAAAAAGAATTAGGACTTACGCAGTTGAACTGAAAAATCAACAGCATCGAACCGTTAACTGTTTAAAACGTAACTTTAATCCACAGTTTTTGTCGTAATTGATTTTGTTCCTCAAGTGCGTAAGTCCTAAGAATGTATGTTAAGATATCATAATAATGTCTGCTTAAGAGGGAGACCCCTATATTTCGAGTGGAGAGATTTTTGTAGGTATAGAAATGTGAATTTATCAGAACATATAGCTTAGATTTATTAGTTTTTTGAAAACGCACATAAAATTCTTCTAATCACAAGCACAAAGAAATGAAAGTACTTAAAAGAACTTTCATGCTAAACAATATTTTTTCTGATAGATCAGGTCATCAGTACAATGAATATATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATGAATACATATAATCAGTTTTTTCTCTATTGTATAAAACTTCTCCAAAAACAAACTAGCCTTTTTAATAATAAATTATATATAGTATTAACTCTATAACTAAACAACATTATTTTACTGATAAGCAAATAAAATCTTATTTTATTTTGCTGCCTAGAACTTCCAATCTCTTTAATGGAAACCATGGGGTCTGGGGGTTATATAAACGTTCCAGTGGAAATTAGGGGGTCTACCCTATTTTTTACTCTTTTCTTTGTTTATCTTTCTTTGATTTCCTTAACTTTCTTAACTTTCTTTAATTTCCTAGCTTTTTTATTTTCTTTATCTTTTTCTTACTTTTTCAATGCAAATAATTCTGAGTTTTAAAATTTATCTAAAGTTTTCTATTTTCTAAACTCTGTAAACCCTTTTATTCACAGGTGATTTGATTTACATGATTCTAATTTTATCTCAAAATTTTTATTCTTTAATTTTATATAAAAATATTCTAATTTTCATAACTTCTTCCATTCGAAAGGAAGGGTTTAAATTCAACCTCCATTGATTCTGGAATTCATAATTTTTTGTTTCAGCTATAATAAGTTATATAACGTTGGTTTTTATGGTAGATATTTAAGGTATAAAATATTTCCAGTGGAAATCAGGGGGTCTTTACCATAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATATAGCTTAAATTCACTTGTTTATAAACCAATTTCACCTAAAATTTCAACAAAAGAAGATATGGAATATAGATTTTATCTGGTAGGCGAGGTATCTTAATACTTAAAACTCGCCCGCCATTTTATCATTAGCTAGTAGAAAATAAGGGTTTCAGGCATTAA

ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TCYAGTGGAAAWYADGGGKTY

StartP-valueSite
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10682.49e-10CATAACTTCTTCCATTCGAAAGGAAGGGTTTAAATTCAACC
13917.03e-10TTTATCATTAGCTAGTAGAAAATAAGGGTTTCAGGCATTAA

Motif TTGATAAACATTTGATAAACA

StartP-valueSite
5279.57e-12TGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAAC
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4839.57e-12ATGAATATATTTGATAAACATTTGATAAACATTTGATAAAC
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9605.88e-09TTTCTAAACTCTGTAAACCCTTTTATTCACAGGTGATTTGA

Motif CAWMAGTACAAWGAA

StartP-valueSite
766.19e-09CCTCTCCTAACAACAGGACAAGGAAGTATCCAAAA
3911.99e-08TTCTTCTAATCACAAGCACAAAGAAATGAAAGTAC
4633.97e-08TAGATCAGGTCATCAGTACAATGAATATATTTGAT
2241.65e-07TCCTCAAGTGCGTAAGTCCTAAGAATGTATGTTAA

The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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aORI10010290 88.991 109 12 0 1 109 1 109 5.02e-33 135
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aORI10010282 80.606 165 28 4 1155 1317 993 1155 1.09e-29 124
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aORI10010283 80.606 165 27 5 1155 1317 951 1112 3.91e-29 122
aORI10010018 80.606 165 27 5 1155 1317 635 474 3.91e-29 122
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aORI10010280 77.976 168 33 4 1170 1335 1101 1266 5.1e-23 102
aORI10010279 77.976 168 33 4 1170 1335 1097 1262 5.1e-23 102