| RefSeq | NZ_CP009517.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | aORI10010380 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1487 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.2656 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 4560113..1153 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
CTTCTTCAACTTCCAATTTTTCCTAATTCCTTAATTTTTCCTTATCTCTTTCTTATTTTTTCAATATAAGGAATTTTTAATTCGTACACCCAGAAATTTCTCTAAAATTTCTTAAATTCTGTAAATTCATTTATTTACGGTGATTCTATTTACATAATTCTAATTTTTATCTCAAAATTTTTATACTTCAATTTTATCCAAAAATATTATTATTTTTTATAACTTACTCCATTTGAAAGTAAGGGTTTTTAACTCAGTCTCAATTAGTTTTGAAACTTATAACTTTTTTATTTCAAATATACTCAAGCTATTCAATGTTGGTTTTTGTGGCAGATACCTGAAGTATAAATCCGTTCCAGTCGAAATAAAGGGGTCTTTACCACAACAATTAATACGGTGTACTTCCATTGCATCTACTGCAAATATAGCTTAAAATTACTTGCTTATAAACCAATTTTACCTAAAGTTTTAGTAAAAGAAGATCCGGAATATAGATTTTATCTAGCTTACAAGGTATCTTAATACTTAAGATTCGCCCGCCATTTATCAGAAAATGGTAGAAAATAAAAATTTAGGCATTAACTGTGAGAAAGATGTATCTTCTATCCATTTCTCTCATTAAGCAGAATTTATAGGGTTTTTCATAAAGATACAAACAATTAAGTAAAATTTCAGAATCCTAAAATAAATTTTAGTTCTTGGCACTTAAACTTTAGTTCCAGATATTGACAGTTAAGACTTCAAAGTTAAGAGTTTAACCTTTTCCCTCTTTCCCTCTTTCCCTCTTTCCCTCTTTCCAAACCCCTTAAATGGATCCTACTTACAATCCCCAAATCTCCTAAAATTCCTTATTGCAATTATAATAATTATTAAGCCACTCTATTAAGCCCCACTCTAGAAACTTGCTAAATAGCTGTTATAAGGTCAATATAAAGCTTGCCAAGGAGTTATGGCTATAATTGTCTAAGCATTTAAAATGGAAAATCTAAAAAATAACTGGAAAATCTAAAAAATAACTGGAAAATCTAAAAATTTACTCTAAAAATTTACTCTAAAAATAGAATATTCAATAGCAGTAATTCGAAGGATTGAATCAACTGCAAACTATCAAAAAATTTTCCTTATTTCCGACAGCAGTAAAACGCTTAAAATTAGTAAAGCACTTAAAGTTAATAAAATGCTTAAAATTAGTAAAACACTTAAAGTTAAAAATACTTAAAATTAAAAACACTTAAAGTTAAAAACACTTAAAATTAAAAACACTTAAAATCAGTATTACAAACATAAAAATTAAAGTAGTTCAGAGAAAGTGGACAGAGTTTATCGATTGTATTAGTTCATTATATATACTCTCTATATAATCTCATATTAAAATTACTATATTAATTAATTTGACATGCAACGGTTCGCGTTGTATTAATTATCTGCATTAGAAGTATCTTAATCTCTTATATTGCTTAATATCATAATTTTTATAGAGGATCTTC
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ORB
AT-rich region
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| The information of repeat sequences |
Motif AAAACACTTAAARTT
Motif TTTCCCTC
Motif SYAKTTSAAAKWAAGKGK
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| The result of BLAST |
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