RefSeq NC_018590.1
Accession number NC_018590.1
DoriC accession number ORI96010291
OriC length 503 nt
OriC AT content 0.687873
The location of oriC region 2840000..317 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1161.46e-07GTCATTTTTTTGTGGATAACCTTTTAATCTA
2512.06e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4515.60e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
855.60e-07TTCCAGAAAGTGTGGATAACTCGTTAATAAC
4191.07e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGG

Motif TTAYACACAAK

StartP-valueSite
2202.24e-07ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAA
2311.34e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCT
1661.34e-06TAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGA
1452.83e-06TACTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAA
3754.17e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTAC

Motif TGTGGATA

StartP-valueSite
3981.91e-05ATTTTTACTTTGTGGATATTTTTTAACA
2841.91e-05TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAA
1811.91e-05CACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTA
3605.80e-05GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTA
2728.60e-05GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010291 100.0 503 0 0 1 503 1 503 0.0 929
ORI96010130 99.802 504 0 1 1 503 1 504 0.0 924
ORI96010125 99.802 504 0 1 1 503 1 504 0.0 924
ORI92710462 99.802 504 0 1 1 503 504 1 0.0 924
ORI96010293 97.431 506 9 4 1 503 1 505 0.0 859
ORI96010285 97.431 506 9 4 1 503 1 505 0.0 859
ORI96010279 97.431 506 9 4 1 503 1 505 0.0 859
ORI96010281 97.233 506 10 4 1 503 1 505 0.0 854
ORI96010189 97.233 506 10 4 1 503 1 505 0.0 854
ORI93010531 97.233 506 10 4 1 503 1 505 0.0 854
ORI10010037 97.233 506 10 4 1 503 1 505 0.0 854
ORI96010283 97.233 506 9 5 1 503 1 504 0.0 852
ORI96010311 97.036 506 10 5 1 503 1 504 0.0 846
ORI96010295 96.252 507 12 6 1 503 1 504 0.0 824
ORI96010133 96.252 507 12 6 1 503 1 504 0.0 824
ORI96010297 96.055 507 13 6 1 503 1 504 0.0 819
ORI96010139 96.055 507 13 6 1 503 1 504 0.0 819
ORI96010289 95.858 507 14 6 1 503 1 504 0.0 813
ORI96010287 95.858 507 14 6 1 503 1 504 0.0 813
ORI96010137 95.858 507 14 6 1 503 206 709 0.0 813
ORI96010135 95.858 507 14 6 1 503 1 504 0.0 813
ORI93010634 95.858 507 14 6 1 503 504 1 0.0 813
ORI93010632 95.858 507 14 6 1 503 504 1 0.0 813
ORI10010048 95.858 507 14 6 1 503 1 504 0.0 813
ORI10010050 94.872 507 21 4 1 503 1 506 0.0 787
ORI50010245 93.083 506 30 4 1 503 1 504 0.0 736
ORI95010923 90.766 509 35 9 2 503 1 504 0.0 669
ORI93010644 89.844 512 37 12 1 503 1 506 0.0 643