RefSeq NC_013766.1
Accession number NC_013766.1
DoriC accession number ORI93010632
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.678571
The location of oriC region 3031972..187 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RGTTATCCACA

StartP-valueSite
3781.57e-07TAATTGAAAAGGTTATCCACAATAAAAAGGC
2432.24e-07TGTGAAAAACGGTTGTCCACAGCCAGTTAAC
4095.90e-07GTTATTCAGGAGTTATCCACACTTTCTAGGA
425.90e-07GATGCTATAAAGTTATCCACAGATAGAAAAA
741.11e-06CTATGGATAAGGTTATCCAAACACTGTTAAA

Motif TTGTGTRTAA

StartP-valueSite
3291.46e-06CCACAAGCCATTGTGTGTAATTAACCACTA
2751.46e-06TGTGTATAACTTGTGTGTAAAGAAATCTGT
3504.86e-06TAACCACTAATTGTGTATAAGTTTAAACTA
2644.86e-06GCCAGTTAACTTGTGTATAACTTGTGTGTA
1207.46e-06TAAAAATGTATTGTGGATAACTTTAGTTTT

Motif AAYTATCCACA

StartP-valueSite
3131.70e-06TGTTAGATTTAATTATCCACAAGCCATTGTG
961.70e-06ACTGTTAAAAAATTATCCACAAAGTAAAAAT
2104.14e-06GACTTACCAAATCTATCCACAAAACTGTCCA
2228.84e-06CTATCCACAAAACTGTCCAGATGTGAAAAAC
1341.11e-05GGATAACTTTAGTTTTCCCCAGCTATATTTC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010289 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI96010287 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI96010137 100.0 504 0 0 1 504 709 206 0.0 931
ORI96010135 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI93010634 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI93010632 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI10010048 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI96010297 99.802 504 1 0 1 504 504 1 0.0 926
ORI96010139 99.802 504 1 0 1 504 504 1 0.0 926
ORI96010295 99.603 504 2 0 1 504 504 1 0.0 920
ORI96010133 99.603 504 2 0 1 504 504 1 0.0 920
ORI96010281 97.036 506 12 3 1 504 505 1 0.0 848
ORI96010189 97.036 506 12 3 1 504 505 1 0.0 848
ORI93010531 97.036 506 12 3 1 504 505 1 0.0 848
ORI10010037 97.036 506 12 3 1 504 505 1 0.0 848
ORI96010311 96.838 506 12 4 1 504 504 1 0.0 843
ORI96010293 96.838 506 13 3 1 504 505 1 0.0 843
ORI96010285 96.838 506 13 3 1 504 505 1 0.0 843
ORI96010279 96.838 506 13 3 1 504 505 1 0.0 843
ORI96010283 96.64 506 13 4 1 504 504 1 0.0 837
ORI96010130 96.055 507 14 5 1 504 504 1 0.0 821
ORI96010125 96.055 507 14 5 1 504 504 1 0.0 821
ORI92710462 96.055 507 14 5 1 504 1 504 0.0 821
ORI96010291 95.858 507 14 6 1 504 503 1 0.0 813
ORI10010050 94.488 508 22 6 1 504 506 1 0.0 778
ORI50010245 92.913 508 28 8 1 504 504 1 0.0 732
ORI95010923 90.909 506 41 5 1 503 504 1 0.0 675
ORI93010644 90.766 509 39 8 1 504 506 1 0.0 673