RefSeq NC_017546.1
Accession number NC_017546.1
DoriC accession number ORI96010137
OriC length 709 nt
OriC AT content 0.686883
The location of oriC region 2973347..254 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
3221.41e-07GCCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTA
4572.01e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
6585.33e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
2915.33e-07TCCTAGAAAGTGTGGATAACTCCTGAATAAC
6261.04e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATAG

Motif TTAYACACAAK

StartP-valueSite
4262.40e-07ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAA
4378.03e-07TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCT
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3513.00e-06TAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAA
5814.44e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTAC

Motif TGTGGATARTT

StartP-valueSite
6041.50e-06ATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
3871.50e-06CACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACA
4903.57e-06TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTGGTAAGTC
4787.73e-06GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAG
5668.78e-06GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

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ORI96010189 97.036 506 12 3 206 709 1 505 0.0 848
ORI93010531 97.036 506 12 3 206 709 1 505 0.0 848
ORI10010037 97.036 506 12 3 206 709 1 505 0.0 848
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ORI96010285 96.838 506 13 3 206 709 1 505 0.0 843
ORI96010279 96.838 506 13 3 206 709 1 505 0.0 843
ORI96010283 96.64 506 13 4 206 709 1 504 0.0 837
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ORI96010125 96.055 507 14 5 206 709 1 504 0.0 821
ORI92710462 96.055 507 14 5 206 709 504 1 0.0 821
ORI96010291 95.858 507 14 6 206 709 1 503 0.0 813
ORI10010050 94.488 508 22 6 206 709 1 506 0.0 778
ORI50010245 92.913 508 28 8 206 709 1 504 0.0 732
ORI95010923 90.909 506 41 5 207 709 1 504 0.0 675
ORI93010644 90.766 509 39 8 206 709 1 506 0.0 673