RefSeq NC_016011.1
Accession number NC_016011.1
DoriC accession number ORI95010923
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.688492
The location of oriC region 2928693..317 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif YTGTGGATAACYTT

StartP-valueSite
4521.97e-08CTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTAAAGCATCCA
1161.97e-08AGACTTTTTATTGTGGATAACCTTCTAATTTAGT
2515.62e-08AGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATC
2842.15e-07CTGGACAGTTTTGTGGATAAATTTGGTAAGTCCT
3982.90e-07CGTTTTCACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGCGT

Motif TTAYACACAA

StartP-valueSite
2211.52e-06ACAGTTTTCTTTACACACAAGTTATACACA
1671.52e-06TAGTGGGAAATTACACACAAAGGCTTGTGG
2325.21e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGC
1465.21e-06TAGTTCAACTTTATACACAATTAGTGGGAA
3767.88e-06GAAAATAAAGTTATCCACAATACGTTTTCA

Motif GKGGRWAA

StartP-valueSite
3625.98e-06AAATATAGCTGGGGGAAAATAAAGTTAT
1592.06e-05TACACAATTAGTGGGAAATTACACACAA
4945.23e-05ACATACAAAGGGGGGTTACTA
1835.23e-05ACAAAGGCTTGTGGATAATTAATTATAA
875.23e-05ATCAAAAAGTGTGGATAAGTACCTGTTT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI95010923 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI93010644 92.673 505 36 1 1 504 2 506 0.0 726
ORI96010293 91.321 507 38 6 1 504 2 505 0.0 688
ORI96010285 91.321 507 38 6 1 504 2 505 0.0 688
ORI96010279 91.321 507 38 6 1 504 2 505 0.0 688
ORI96010295 91.304 506 39 5 1 504 2 504 0.0 686
ORI96010133 91.304 506 39 5 1 504 2 504 0.0 686
ORI96010281 91.124 507 39 6 1 504 2 505 0.0 682
ORI96010189 91.124 507 39 6 1 504 2 505 0.0 682
ORI93010531 91.124 507 39 6 1 504 2 505 0.0 682
ORI10010037 91.124 507 39 6 1 504 2 505 0.0 682
ORI96010297 91.107 506 40 5 1 504 2 504 0.0 680
ORI96010283 91.124 507 38 7 1 504 2 504 0.0 680
ORI96010139 91.107 506 40 5 1 504 2 504 0.0 680
ORI10010050 90.927 507 41 5 1 504 2 506 0.0 676
ORI96010311 90.927 507 39 7 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010289 90.909 506 41 5 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010287 90.909 506 41 5 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010137 90.909 506 41 5 1 504 207 709 0.0 675
ORI96010135 90.909 506 41 5 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010130 90.963 509 35 8 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010125 90.963 509 35 8 1 504 2 504 0.0 675
ORI93010634 90.909 506 41 5 1 504 503 1 0.0 675
ORI93010632 90.909 506 41 5 1 504 503 1 0.0 675
ORI92710462 90.963 509 35 8 1 504 503 1 0.0 675
ORI50010245 90.945 508 37 8 1 504 2 504 0.0 675
ORI10010048 90.909 506 41 5 1 504 2 504 0.0 675
ORI96010291 90.766 509 35 9 1 504 2 503 0.0 669