RefSeq NC_017547.1
Accession number NC_017547.1
DoriC accession number ORI96010139
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.680556
The location of oriC region 2874245..317 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1171.53e-07GCCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTA
2522.19e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4535.79e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
865.79e-07TCCTAGAAAGTGTGGATAACTCCTGAATAAC
4211.10e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATAG

Motif TTAYACACAA

StartP-valueSite
2211.47e-06ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACA
1671.47e-06TAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGG
2324.93e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGC
1464.93e-06TAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTA
3767.57e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTA

Motif TGTGGATARTT

StartP-valueSite
3991.67e-06ATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
1821.67e-06CACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACA
2854.04e-06TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTGGTAAGTC
2739.36e-06GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAG
3611.09e-05GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010297 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010139 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010295 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010289 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
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ORI96010137 99.802 504 1 0 1 504 206 709 0.0 926
ORI96010135 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010133 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI93010634 99.802 504 1 0 1 504 504 1 0.0 926
ORI93010632 99.802 504 1 0 1 504 504 1 0.0 926
ORI10010048 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010281 97.233 506 11 3 1 504 1 505 0.0 854
ORI96010189 97.233 506 11 3 1 504 1 505 0.0 854
ORI93010531 97.233 506 11 3 1 504 1 505 0.0 854
ORI10010037 97.233 506 11 3 1 504 1 505 0.0 854
ORI96010311 97.036 506 11 4 1 504 1 504 0.0 848
ORI96010293 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI96010285 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI96010279 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI96010283 96.838 506 12 4 1 504 1 504 0.0 843
ORI96010130 96.252 507 13 5 1 504 1 504 0.0 826
ORI96010125 96.252 507 13 5 1 504 1 504 0.0 826
ORI92710462 96.252 507 13 5 1 504 504 1 0.0 826
ORI96010291 96.055 507 13 6 1 504 1 503 0.0 819
ORI10010050 94.291 508 23 6 1 504 1 506 0.0 773
ORI50010245 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI95010923 91.107 506 40 5 2 504 1 504 0.0 680
ORI93010644 90.963 509 38 8 1 504 1 506 0.0 678