RefSeq NC_018586.1
Accession number NC_018586.1
DoriC accession number ORI96010283
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.690476
The location of oriC region 2976773..318 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1171.47e-07ACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTA
2512.06e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4525.72e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
865.72e-07TTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAAC
4201.09e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGG

Motif TTAYACACAAK

StartP-valueSite
2202.20e-07ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAA
2311.32e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCT
1671.32e-06TAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGT
1462.79e-06TAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAA
3754.07e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTAC

Motif TGTGGAWAR

StartP-valueSite
2844.39e-06TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAG
3981.71e-05ATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACA
2722.27e-05GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGAT
3603.42e-05GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010283 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010311 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010293 99.802 505 0 1 1 504 1 505 0.0 926
ORI96010285 99.802 505 0 1 1 504 1 505 0.0 926
ORI96010279 99.802 505 0 1 1 504 1 505 0.0 926
ORI96010281 99.604 505 1 1 1 504 1 505 0.0 920
ORI96010189 99.604 505 1 1 1 504 1 505 0.0 920
ORI93010531 99.604 505 1 1 1 504 1 505 0.0 920
ORI10010037 99.604 505 1 1 1 504 1 505 0.0 920
ORI96010130 97.431 506 9 4 1 504 1 504 0.0 859
ORI96010125 97.431 506 9 4 1 504 1 504 0.0 859
ORI92710462 97.431 506 9 4 1 504 504 1 0.0 859
ORI96010291 97.233 506 9 5 1 504 1 503 0.0 852
ORI96010295 97.036 506 11 4 1 504 1 504 0.0 848
ORI96010133 97.036 506 11 4 1 504 1 504 0.0 848
ORI96010297 96.838 506 12 4 1 504 1 504 0.0 843
ORI96010139 96.838 506 12 4 1 504 1 504 0.0 843
ORI96010289 96.64 506 13 4 1 504 1 504 0.0 837
ORI96010287 96.64 506 13 4 1 504 1 504 0.0 837
ORI96010137 96.64 506 13 4 1 504 206 709 0.0 837
ORI96010135 96.64 506 13 4 1 504 1 504 0.0 837
ORI93010634 96.64 506 13 4 1 504 504 1 0.0 837
ORI93010632 96.64 506 13 4 1 504 504 1 0.0 837
ORI10010048 96.64 506 13 4 1 504 1 504 0.0 837
ORI10010050 95.276 508 18 5 1 504 1 506 0.0 800
ORI50010245 93.294 507 28 6 1 504 1 504 0.0 743
ORI95010923 91.124 507 38 7 2 504 1 504 0.0 680
ORI93010644 90.373 509 41 8 1 504 1 506 0.0 662