RefSeq NC_018584.1
Accession number NC_018584.1
DoriC accession number ORI96010279
OriC length 505 nt
OriC AT content 0.691089
The location of oriC region 2951619..318 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaa
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
-TTTTCACAACCTCATTTATTTGTCTTTTTTCTTATTCTGGTAAATAGTTTAACACATTGTCGTAATGAAATCCTTTTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAACACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACAATTTCGTTACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTCCTTGCTATCAGAGTGATTTTCTGATATTATAATTCCTGTCGAATAGAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGGCTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATCCATTTACATTACATAAAAAAGGGGGGTTACTAdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1171.44e-07ACCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTA
2522.02e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4535.62e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
865.62e-07TTCCGGAAAGTGTGGATAACTAGTTAATAAC
4211.07e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGG

Motif TTAYACACAA

StartP-valueSite
2211.42e-06ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACA
1671.42e-06TAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGG
2324.98e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGC
1464.98e-06TAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTA
3767.53e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTA

Motif TGTGGATARTT

StartP-valueSite
3991.80e-06ATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
1821.80e-06CACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACA
2854.11e-06TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTC
2737.95e-06GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAG
3619.99e-06GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010293 100.0 505 0 0 1 505 1 505 0.0 933
ORI96010285 100.0 505 0 0 1 505 1 505 0.0 933
ORI96010279 100.0 505 0 0 1 505 1 505 0.0 933
ORI96010281 99.802 505 1 0 1 505 1 505 0.0 928
ORI96010189 99.802 505 1 0 1 505 1 505 0.0 928
ORI93010531 99.802 505 1 0 1 505 1 505 0.0 928
ORI10010037 99.802 505 1 0 1 505 1 505 0.0 928
ORI96010283 99.802 505 0 1 1 505 1 504 0.0 926
ORI96010311 99.604 505 1 1 1 505 1 504 0.0 920
ORI96010130 97.628 506 9 3 1 505 1 504 0.0 865
ORI96010125 97.628 506 9 3 1 505 1 504 0.0 865
ORI92710462 97.628 506 9 3 1 505 504 1 0.0 865
ORI96010291 97.431 506 9 4 1 505 1 503 0.0 859
ORI96010295 97.233 506 11 3 1 505 1 504 0.0 854
ORI96010133 97.233 506 11 3 1 505 1 504 0.0 854
ORI96010297 97.036 506 12 3 1 505 1 504 0.0 848
ORI96010139 97.036 506 12 3 1 505 1 504 0.0 848
ORI96010289 96.838 506 13 3 1 505 1 504 0.0 843
ORI96010287 96.838 506 13 3 1 505 1 504 0.0 843
ORI96010137 96.838 506 13 3 1 505 206 709 0.0 843
ORI96010135 96.838 506 13 3 1 505 1 504 0.0 843
ORI93010634 96.838 506 13 3 1 505 504 1 0.0 843
ORI93010632 96.838 506 13 3 1 505 504 1 0.0 843
ORI10010048 96.838 506 13 3 1 505 1 504 0.0 843
ORI10010050 95.472 508 18 4 1 505 1 506 0.0 806
ORI50010245 93.491 507 28 5 1 505 1 504 0.0 749
ORI95010923 91.321 507 38 6 2 505 1 504 0.0 688
ORI93010644 90.57 509 41 7 1 505 1 506 0.0 667