RefSeq NC_017545.1
Accession number NC_017545.1
DoriC accession number ORI96010135
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.678571
The location of oriC region 3000278..317 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1171.57e-07GCCTTTTTATTGTGGATAACCTTTTCAATTA
2522.24e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4535.90e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTTATAGCATC
865.90e-07TCCTAGAAAGTGTGGATAACTCCTGAATAAC
4211.11e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATAG

Motif TTAYACACAA

StartP-valueSite
2211.46e-06ACAGATTTCTTTACACACAAGTTATACACA
1671.46e-06TAGTGGTTAATTACACACAATGGCTTGTGG
2324.86e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGC
1464.86e-06TAGTTTAAACTTATACACAATTAGTGGTTA
3767.46e-06AAAACTAAAGTTATCCACAATACATTTTTA

Motif TGTGGATARTT

StartP-valueSite
3991.70e-06ATTTTTACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
1821.70e-06CACAATGGCTTGTGGATAATTAAATCTAACA
2854.14e-06TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTGGTAAGTC
2738.84e-06GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAG
3611.11e-05GAAATATAGCTGGGGAAAACTAAAGTTATCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010289 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010287 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010137 100.0 504 0 0 1 504 206 709 0.0 931
ORI96010135 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI93010634 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI93010632 100.0 504 0 0 1 504 504 1 0.0 931
ORI10010048 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI96010297 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010139 99.802 504 1 0 1 504 1 504 0.0 926
ORI96010295 99.603 504 2 0 1 504 1 504 0.0 920
ORI96010133 99.603 504 2 0 1 504 1 504 0.0 920
ORI96010281 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI96010189 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI93010531 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI10010037 97.036 506 12 3 1 504 1 505 0.0 848
ORI96010311 96.838 506 12 4 1 504 1 504 0.0 843
ORI96010293 96.838 506 13 3 1 504 1 505 0.0 843
ORI96010285 96.838 506 13 3 1 504 1 505 0.0 843
ORI96010279 96.838 506 13 3 1 504 1 505 0.0 843
ORI96010283 96.64 506 13 4 1 504 1 504 0.0 837
ORI96010130 96.055 507 14 5 1 504 1 504 0.0 821
ORI96010125 96.055 507 14 5 1 504 1 504 0.0 821
ORI92710462 96.055 507 14 5 1 504 504 1 0.0 821
ORI96010291 95.858 507 14 6 1 504 1 503 0.0 813
ORI10010050 94.488 508 22 6 1 504 1 506 0.0 778
ORI50010245 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI95010923 90.909 506 41 5 2 504 1 504 0.0 675
ORI93010644 90.766 509 39 8 1 504 1 506 0.0 673