RefSeq NC_013891.1
Accession number NC_013891.1
DoriC accession number ORI93010644
OriC length 506 nt
OriC AT content 0.677866
The location of oriC region 2797449..318 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CTGTGGATAAC

StartP-valueSite
4531.51e-07CTTTTTCTATCTGTGGATAACTTTAGATCAT
1171.51e-07AGCCTTTTTACTGTGGATAACATTTTAGAAA
2522.21e-07AGTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTAAC
866.81e-07TTCCCAAGATATGTGGATAACTACCTGTTTT
4211.67e-06TTTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCACG

Motif TGTGGATAAWT

StartP-valueSite
4006.93e-07ATTTTCACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
1836.93e-07CACAATGCCTTGTGGATAATTAAATCTAACA
2861.27e-06TGGACAGTTTTGTGGATAAATTTGGTAAGTC
3626.39e-06GAAATATAGCTGGGGAAAAATAAAGTTATCC
2741.06e-05GTTTTTAACATCTGGACAGTTTTGTGGATAA

Motif TTAYACACAAK

StartP-valueSite
2222.89e-07ACAGTTTTCTTTACACACAAGTTATACACAA
2331.05e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCT
1684.45e-06AAGTGGTAACTTACGCACAATGCCTTGTGGA
1474.45e-06AAGTTCAACTTTATACACAATAAGTGGTAAC
3776.46e-06AAAAATAAAGTTATCCACAATACATTTTCAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93010644 100.0 506 0 0 1 506 1 506 0.0 935
ORI95010923 92.673 505 36 1 2 506 1 504 0.0 726
ORI96010295 91.159 509 37 8 1 506 1 504 0.0 684
ORI96010133 91.159 509 37 8 1 506 1 504 0.0 684
ORI96010297 90.963 509 38 8 1 506 1 504 0.0 678
ORI96010139 90.963 509 38 8 1 506 1 504 0.0 678
ORI10010050 90.766 509 41 6 1 506 1 506 0.0 675
ORI96010289 90.766 509 39 8 1 506 1 504 0.0 673
ORI96010287 90.766 509 39 8 1 506 1 504 0.0 673
ORI96010137 90.766 509 39 8 1 506 206 709 0.0 673
ORI96010135 90.766 509 39 8 1 506 1 504 0.0 673
ORI93010634 90.766 509 39 8 1 506 504 1 0.0 673
ORI93010632 90.766 509 39 8 1 506 504 1 0.0 673
ORI10010048 90.766 509 39 8 1 506 1 504 0.0 673
ORI96010293 90.57 509 41 7 1 506 1 505 0.0 667
ORI96010285 90.57 509 41 7 1 506 1 505 0.0 667
ORI96010279 90.57 509 41 7 1 506 1 505 0.0 667
ORI96010283 90.373 509 41 8 1 506 1 504 0.0 662
ORI96010281 90.373 509 42 7 1 506 1 505 0.0 662
ORI96010189 90.373 509 42 7 1 506 1 505 0.0 662
ORI93010531 90.373 509 42 7 1 506 1 505 0.0 662
ORI10010037 90.373 509 42 7 1 506 1 505 0.0 662
ORI96010311 90.177 509 42 8 1 506 1 504 0.0 656
ORI96010130 90.039 512 37 11 1 506 1 504 0.0 651
ORI96010125 90.039 512 37 11 1 506 1 504 0.0 651
ORI92710462 90.039 512 37 11 1 506 504 1 0.0 651
ORI50010245 90.02 511 39 10 1 506 1 504 0.0 651
ORI96010291 89.844 512 37 12 1 506 1 503 0.0 643