RefSeq NC_008555.1
Accession number NC_008555.1
DoriC accession number ORI50010245
OriC length 504 nt
OriC AT content 0.68254
The location of oriC region 2813944..317 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAACY

StartP-valueSite
1171.50e-07CTCCTTTGATTGTGGATAACCTTTTATTTAA
2522.14e-07GTTAACTGGCTGTGGACAACCGTTTTTCACA
4535.67e-07TTTTTCTATCTGTGGATAACTTATAGCATCC
4211.29e-06TTTAACAGTGTTTGGATAACCTTATCCATGG
861.63e-06CCTCAAAAAGTGTGGATAAGTAGTGAATAAC

Motif TTAYACACAAK

StartP-valueSite
2212.36e-07ACAGTTTTCTTTACACACAAGTTATACACAA
2321.36e-06TACACACAAGTTATACACAAGTTAACTGGCT
1671.36e-06TAGTGGTTATTTACACACAATGACTTGTGGA
1462.85e-06AAGTTCAAACTTATACACAATTAGTGGTTAT
3764.20e-06AAAAATAAAGTTATCCACAATCCGTTTTCAC

Motif TGTGGATARWT

StartP-valueSite
2857.68e-07TGGACAGTTTTGTGGATAGATTTTGTAAGTC
3991.59e-06GTTTTCACTTTGTGGATAATTTTTTAACAGT
1821.59e-06CACAATGACTTGTGGATAATTAATTCTAACA
3618.83e-06GAAATATAGCTGGGGAAAAATAAAGTTATCC
2738.83e-06GTTTTTCACATCTGGACAGTTTTGTGGATAG
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI50010245 100.0 504 0 0 1 504 1 504 0.0 931
ORI10010050 95.652 506 20 2 1 504 1 506 0.0 811
ORI96010293 93.491 507 28 5 1 504 1 505 0.0 749
ORI96010285 93.491 507 28 5 1 504 1 505 0.0 749
ORI96010279 93.491 507 28 5 1 504 1 505 0.0 749
ORI96010283 93.294 507 28 6 1 504 1 504 0.0 743
ORI96010281 93.294 507 29 5 1 504 1 505 0.0 743
ORI96010189 93.294 507 29 5 1 504 1 505 0.0 743
ORI96010130 93.281 506 30 3 1 504 1 504 0.0 743
ORI96010125 93.281 506 30 3 1 504 1 504 0.0 743
ORI93010531 93.294 507 29 5 1 504 1 505 0.0 743
ORI92710462 93.281 506 30 3 1 504 504 1 0.0 743
ORI10010037 93.294 507 29 5 1 504 1 505 0.0 743
ORI96010311 93.097 507 29 6 1 504 1 504 0.0 737
ORI96010291 93.083 506 30 4 1 504 1 503 0.0 736
ORI96010297 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010295 92.899 507 30 6 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010289 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010287 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010139 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010137 92.913 508 28 8 1 504 206 709 0.0 732
ORI96010135 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI96010133 92.899 507 30 6 1 504 1 504 0.0 732
ORI93010634 92.913 508 28 8 1 504 504 1 0.0 732
ORI93010632 92.913 508 28 8 1 504 504 1 0.0 732
ORI10010048 92.913 508 28 8 1 504 1 504 0.0 732
ORI95010923 90.945 508 37 8 2 504 1 504 0.0 675
ORI93010644 90.02 511 39 10 1 504 1 506 0.0 651