RefSeq NZ_CP019976
DoriC accession number pORI00000933
OriC length 1157 nt
OriC AT content 0.6301
The location of oriC region 16437..17593 nt
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OriC map
OriC sequences
AAAATCCTCCTTCAAGATTAACTACTTAACAAAATTATAAAGAGCTTTCTAATAGGGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCACACCTTGGGAGAGTAAGCATACAGCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGATTATAAAAAGAGGAGGCAAAATTTCCCGCCTAAAAAACTCCTGCTTTTTTCCTCAAACAAGTTCGCGAATTTTTCTAAACTGGGAAACTCGCTCCCTACGGTCACTAAAAATGTGTGATCGCTACGCTCTCACATTATACTGCGCAGTCGCCTAAAGGCTCCTTTGCTTAAAAACAGTTCATAAAGAACTCCTTTGAAAAGTTCTGAGCGTTTGTTTAAGCCGTTTTAAGACAGTCTTAGTATAAAAACCCTTATCTTGTTCTCAAAGCGCCTTACAGGCCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTAAAATGTTCTATAAGACCTCTAAAATTAGATCTAAGGCGTTTTAAAGTTGTTTTGGTATAATTATATACCAGAAACGTTTAAAACGCCTTAAAACGCAAATTATAGCCATATGTATTTTTACGGAAGCCGGCACACTCATTTGCAAAGCTTCAGCTTTGCAAATTCGGATTCGCTCAACTCGAAAATTGATTTGTTTTGACTCTGATCGATAGGTGTATTTTTTTAGAAGGATTGCTAGCCAAATACGGAGGTATTTGGTGCAAATAACCGCTTGTCAAAGGGGCGCAAGCTCCCCCTTGAATCCCCCTCAAAATTCACGCTCTACAATACAAAAAAGGCTAGCATTTGCTAGCCACTTTTTGTAAAGTTTCGCTTATTTCACCGAAGGTGAAATTGTTGTTTTGTAACGATTAGGTAGAGCTACATTTTTTTCGTTGTTCAAAGATTCTTACGCCATTTACTATTAAAATCGCAGGTATTCCAAAGTAAAGGAAGAATTGATTAGCAGGCAATACAAAATATAAAATAATGCCAGCAATAACAGCTAAAATTACAGCAATTTTTGTTAATTTCATAAAGCATTCCTCCTAGTTTAAAGTTTTAA
AAAATCCTCCTTCAAGATTAACTACTTAACAAAATTATAAAGAGCTTTCTAATAGGGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCACACCTTGGGAGAGTAAGCATACAGCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGATTATAAAAAGAGGAGGCAAAATTTCCCGCCTAAAAAACTCCTGCTTTTTTCCTCAAACAAGTTCGCGAATTTTTCTAAACTGGGAAACTCGCTCCCTACGGTCACTAAAAATGTGTGATCGCTACGCTCTCACATTATACTGCGCAGTCGCCTAAAGGCTCCTTTGCTTAAAAACAGTTCATAAAGAACTCCTTTGAAAAGTTCTGAGCGTTTGTTTAAGCCGTTTTAAGACAGTCTTAGTATAAAAACCCTTATCTTGTTCTCAAAGCGCCTTACAGGCCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCCTAAAATGTTCTATAAGACCTCTAAAATTAGATCTAAGGCGTTTTAAAGTTGTTTTGGTATAATTATATACCAGAAACGTTTAAAACGCCTTAAAACGCAAATTATAGCCATATGTATTTTTACGGAAGCCGGCACACTCATTTGCAAAGCTTCAGCTTTGCAAATTCGGATTCGCTCAACTCGAAAATTGATTTGTTTTGACTCTGATCGATAGGTGTATTTTTTTAGAAGGATTGCTAGCCAAATACGGAGGTATTTGGTGCAAATAACCGCTTGTCAAAGGGGCGCAAGCTCCCCCTTGAATCCCCCTCAAAATTCACGCTCTACAATACAAAAAAGGCTAGCATTTGCTAGCCACTTTTTGTAAAGTTTCGCTTATTTCACCGAAGGTGAAATTGTTGTTTTGTAACGATTAGGTAGAGCTACATTTTTTTCGTTGTTCAAAGATTCTTACGCCATTTACTATTAAAATCGCAGGTATTCCAAAGTAAAGGAAGAATTGATTAGCAGGCAATACAAAATATAAAATAATGCCAGCAATAACAGCTAAAATTACAGCAATTTTTGTTAATTTCATAAAGCATTCCTCCTAGTTTAAAGTTTTAA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CAGACAAAAAGACCCCHAAAA

StartP-valueSite
1541.45e-12CCCTAAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAGATTCTGCAC
881.45e-12CCCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCCAAAAACAGACAAAA
1313.41e-12ACCCTAAAAACAGACAAAAAGACCCCTAAAAAACAGACAAA
1105.22e-11CCCCCAAAAACAGACAAAAAGACCCTAAAAACAGACAAAAA
664.79e-10GGGTCAAGCCCCTAATTAAAGACCCCTAAAAACAGACAAAA

Motif AAGHCGTYTWAARDBWGNTTT

StartP-valueSite
5868.39e-11AATTAGATCTAAGGCGTTTTAAAGTTGTTTTGGTATAATTA
4641.25e-09GCGTTTGTTTAAGCCGTTTTAAGACAGTCTTAGTATAAAAA
2173.91e-09GCCGACGGTAAAGAGGTTTAAAAAGAGGTTTAAAAAGAGAT
3912.01e-08TTATACTGCGCAGTCGCCTAAAGGCTCCTTTGCTTAAAAAC
5653.63e-08AATGTTCTATAAGACCTCTAAAATTAGATCTAAGGCGTTTT

Motif ADMDAYWTNTGTWTTTTTNHTVAARSATKCHYACBMAWTT

StartP-valueSite
9723.55e-14GATTAGGTAGAGCTACATTTTTTTCGTTGTTCAAAGATTCTTACGCCATTTACTATTAAA
6554.76e-14AACGCAAATTATAGCCATATGTATTTTTACGGAAGCCGGCACACTCATTTGCAAAGCTTC
11081.19e-13CTAAAATTACAGCAATTTTTGTTAATTTCATAAAGCATTCCTCCTAGTTTAAAGTTTTAA
7583.71e-13TTTGACTCTGATCGATAGGTGTATTTTTTTAGAAGGATTGCTAGCCAAATACGGAGGTAT
2797.61e-13TTCCCGCCTAAAAAACTCCTGCTTTTTTCCTCAAACAAGTTCGCGAATTTTTCTAAACTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000739 89.465 598 43 19 1 587 1 589 0.0 737
pORI00000597 83.051 295 37 12 266 556 590 305 0.0 255