RefSeq | NZ_CP024670 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00001059 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1052 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6122 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 42668..43719 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCAGCATGGCGGGGCGCTGTACTGCGCGTGTGAGCGTTAGCGAACTACGGGCGCAATGCAGGAGAACTAACAGAACCTCCCTAAAACGCTCTGAATCGCATTTTAAGCGATTTTTTTCATTTCGCATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAGCGCGATTCAGGGCTTCTTAGTGGAAGATCCAAAAAGGATCAAATAACGGATCATATGATCTGAATCTCTCTGGTTTTGAGAAAGGAGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGGCAGGAGCGTAGCGACTGAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTTTTGCGATGTGACATTAGGATCAGTACGCACGAATATTATATTTATTTCAATAAGTTAAAGTTAACGAGGGACAAATTTATGGTCTTGAAAATTGAGATTCATAAGGCATCAAATATTTTTTTGATGATTTTAAGTTATTGAAAGTTATGAGTTTTAATGATTGATGATGTTTGTTTTTAGCTTGCGGGTAATAATCATCGGGGGACAGATTTATGGTAAGGAACCATCATCGTTGCTGGTTTCGTTGAGTTATCCACAGTTCCTGAATATTCGCACGCATTAAAAGCCTTATCTTTTCTTGTTTTTCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGTAGCTCTAATTTATTGATTTTAAGCGTGTTTTTTGTCTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTGATATCCACAAAATGTGTCATAAGAATACTAATTCGTTGTTCTTTCTGGTGAATCTATTTTGAATCTGTTGTTAATCTGCCTTGAATCCAGTGTGGATTTTGAGCATGGATTACCTTTGTGAGATAAATCACAGATATGAAACATGAGAAGATACTCGGTTAAACATGATATTGATTGTGTTGTAATATCATGTTTCTGGTGTTAAAGTCTGATTATCAAGAGTGTTGGAACAATGAGA
TGCAGCATGGCGGGGCGCTGTACTGCGCGTGTGAGCGTTAGCGAACTACGGGCGCAATGCAGGAGAACTAACAGAACCTCCCTAAAACGCTCTGAATCGCATTTTAAGCGATTTTTTTCATTTCGCATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAGCGCGATTCAGGGCTTCTTAGTGGAAGATCCAAAAAGGATCAAATAACGGATCATATGATCTGAATCTCTCTGGTTTTGAGAAAGGAGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGGCAGGAGCGTAGCGACTGAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTTTTGCGATGTGACATTAGGATCAGTACGCACGAATATTATATTTATTTCAATAAGTTAAAGTTAACGAGGGACAAATTTATGGTCTTGAAAATTGAGATTCATAAGGCATCAAATATTTTTTTGATGATTTTAAGTTATTGAAAGTTATGAGTTTTAATGATTGATGATGTTTGTTTTTAGCTTGCGGGTAATAATCATCGGGGGACAGATTTATGGTAAGGAACCATCATCGTTGCTGGTTTCGTTGAGTTATCCACAGTTCCTGAATATTCGCACGCATTAAAAGCCTTATCTTTTCTTGTTTTTCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGTAGCTCTAATTTATTGATTTTAAGCGTGTTTTTTGTCTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTGATATCCACAAAATGTGTCATAAGAATACTAATTCGTTGTTCTTTCTGGTGAATCTATTTTGAATCTGTTGTTAATCTGCCTTGAATCCAGTGTGGATTTTGAGCATGGATTACCTTTGTGAGATAAATCACAGATATGAAACATGAGAAGATACTCGGTTAAACATGATATTGATTGTGTTGTAATATCATGTTTCTGGTGTTAAAGTCTGATTATCAAGAGTGTTGGAACAATGAGA
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif AAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATADCTTCCTCG
Motif GCGDAGCGMBDTACHGVGCGHSKNAGCGG
Motif AATMTGHTYTGAATC
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The result of BLAST |
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