RefSeq NZ_CP025752
DoriC accession number pORI00001084
OriC length 861 nt
OriC AT content 0.6016
The location of oriC region 51199..52059 nt
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OriC map
OriC sequences
TCTCATTATCCCTGTACTCTTGATGTTCTGACTTTAACACCATAAACATGAGATTGCAATGCATCCAATATCATGGTTAACCGAGAAGGCTCTCATGTTTTACATTCGTGATTGGCCCCACAAAGATGCTCCTAATCAAAATTCGTGGCGGATTAAAAGCGGATTAAAAACGGATTAAAAGCGGATTTGCCAGAGAGAACAAGGAATTGGCATCCCTATGCCATATTTTGTGGATATTATTGTGGGTATTACCGAGGACGCTCTCATGTTTAACCGAGGAAGTTCTCATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAAGTTATCATGTTTAGCCGAGGAAACTCTCATGGTTAAGAAAAAAAAACCTTTTATATCATAGAGTTGAATACACTCTAAGTTATTAAGTTATTAAGAAAAATAAGAAAGATAAGTTTTTTAAGTCTGTGCGGATACTCAAGAACTGTGGATAACTCAACAAAACCAATCGTAACAATGATAGTTCCCCACCATAAACCTGCCCCTGATAACTAAGCTCAGTTAATCTAATTTATTGAAATTATTGCGTATGTGCTCTAATACTACATCGCAGAAATTCCGCTTCCTCGCTCACTCAGTCGCTACGCTCCTGCCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTACTTACTCTCAGGCAAATAAAAACTCAATTGATCAATCGATCCATAATTGATCCTTTTCAGATCTAAAGCAGAAAGGGTTAAAAATTCGCTCTGTCGCTTCGTTTACATACTAGCTATCCTACTCACCCACCAATACCAAAAAACGCTTAGAACACGATTCAGAGTGTTTTAGCAGGGTAGC
TCTCATTATCCCTGTACTCTTGATGTTCTGACTTTAACACCATAAACATGAGATTGCAATGCATCCAATATCATGGTTAACCGAGAAGGCTCTCATGTTTTACATTCGTGATTGGCCCCACAAAGATGCTCCTAATCAAAATTCGTGGCGGATTAAAAGCGGATTAAAAACGGATTAAAAGCGGATTTGCCAGAGAGAACAAGGAATTGGCATCCCTATGCCATATTTTGTGGATATTATTGTGGGTATTACCGAGGACGCTCTCATGTTTAACCGAGGAAGTTCTCATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAAGTTATCATGTTTAGCCGAGGAAACTCTCATGGTTAAGAAAAAAAAACCTTTTATATCATAGAGTTGAATACACTCTAAGTTATTAAGTTATTAAGAAAAATAAGAAAGATAAGTTTTTTAAGTCTGTGCGGATACTCAAGAACTGTGGATAACTCAACAAAACCAATCGTAACAATGATAGTTCCCCACCATAAACCTGCCCCTGATAACTAAGCTCAGTTAATCTAATTTATTGAAATTATTGCGTATGTGCTCTAATACTACATCGCAGAAATTCCGCTTCCTCGCTCACTCAGTCGCTACGCTCCTGCCGTTCGGCTGCGGCGAGCGGTACTTACTCTCAGGCAAATAAAAACTCAATTGATCAATCGATCCATAATTGATCCTTTTCAGATCTAAAGCAGAAAGGGTTAAAAATTCGCTCTGTCGCTTCGTTTACATACTAGCTATCCTACTCACCCACCAATACCAAAAAACGCTTAGAACACGATTCAGAGTGTTTTAGCAGGGTAGC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CGAGGAMGHTMTCATGBTTAACCGAGGAAGCTCTCATGBTT

StartP-valueSite
2971.03e-24CATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAAGCTCTCATGCTTAACCGAGGAA
2534.55e-24TGGGTATTACCGAGGACGCTCTCATGTTTAACCGAGGAAGTTCTCATGCTTAACCGAGGAA
3417.42e-22CATGCTTAACCGAGGAAGTTATCATGTTTAGCCGAGGAAACTCTCATGGTTAAGAAAAAAA
601.96e-19GAGATTGCAATGCATCCAATATCATGGTTAACCGAGAAGGCTCTCATGTTTTACATTCGTG

Motif CRGATYWAAAGCRGA

StartP-valueSite
1717.84e-10GGATTAAAAACGGATTAAAAGCGGATTTGCCAGAG
1497.84e-10AAATTCGTGGCGGATTAAAAGCGGATTAAAAACGG
7381.95e-08TGATCCTTTTCAGATCTAAAGCAGAAAGGGTTAAA

Motif TGTGGATA

StartP-valueSite
4911.41e-05ACTCAAGAACTGTGGATAACTCAACAAA
2291.41e-05TGCCATATTTTGTGGATATTATTGTGGG
2412.23e-05TGGATATTATTGTGGGTATTACCGAGGA
4743.30e-05TTTAAGTCTGTGCGGATACTCAAGAACT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000697 84.615 221 28 6 251 468 255 472 0.0 215
pORI00000697 95.522 67 3 0 251 317 321 387 2.26e-24 108
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pORI00001058 98.592 71 1 0 610 680 324 254 6.25e-30 126
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pORI00000723 98.592 71 1 0 610 680 728 798 6.25e-30 126
pORI00000722 98.592 71 1 0 610 680 728 798 6.25e-30 126
pORI00000604 98.592 71 1 0 610 680 324 254 6.25e-30 126
pORI00000578 95.0 80 4 0 610 689 527 448 6.25e-30 126
pORI00000548 95.0 80 4 0 601 680 713 792 6.25e-30 126
pORI00000043 100.0 57 0 0 622 678 829 773 8.14e-24 106
pORI00000056 96.491 57 2 0 622 678 689 633 1.76e-20 95