RefSeq | NZ_CP021735 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000968 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1051 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.6137 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 16648..17698 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCAGCATGGCGGGGCGCTGTACTGCGCGTGTGAGCGTTAGCGAACTACGGGCGCAATGCAGGAGAACTAACAGAACCTCCCTAAAACGCTCTGAATCGCATTTTAAGCGATTTTTTTCATTTCGCATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAGCGCGATTCAGGGCTTCTTAGTGGAAGATCCAAAAAGGATCAAATAACGGATCATATGATCTGAATCTCTCTGGTTTTGAGAAAGGAGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGGCAGGAGCGTAGCGACTGAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTTTTGCGATGTGACATTAGGATCAGTACGCACGAATATTATATTTATTTCAATAAGTTAAAGTTAACTAGGGACAAATTTATGGTCTTGAAAATTGAGATACATAAGGCATCAAATATTTTTTTGATGATTTTATGTTATTGAAAGTTATGAGTTTTAATGATTGATGATGTTTGTTTTAGCTTGCGGGTAATAATCATCGGGGGACAGATTTATGGTAAGGAACCATCATCGTTGCTGGTTTTGTTGAGTTATCCACAGTTCCTGAATATTCGCACGCATTAAAAGCCTTATCTTTTCTTGTTTTTCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGTAGCTCTAATTTATTGATTTTAAGCGTGTTTTTTGTCTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTGATATCCACAAAATGTGTCATAAGAATACTAATTCGTTGTTCTTTCTGGTGAATCTATTTTGAATCTGTTGTTAATCTGCCTTGAATCCAGTGTGGATTTTGAGCATGGATTACCTTTGTGAGATAAATCACAGATATGAAACATGAGAAGATACTCGGTTAAACATGATATTGATTGTGTTGTAATATCATGTTTCTGGTGTTAAAGTCTGATTATCAAGAGTGTTGGAACAATGAGA
TGCAGCATGGCGGGGCGCTGTACTGCGCGTGTGAGCGTTAGCGAACTACGGGCGCAATGCAGGAGAACTAACAGAACCTCCCTAAAACGCTCTGAATCGCATTTTAAGCGATTTTTTTCATTTCGCATGGTTTTCCTCATGGTTGTATCGAACGAAGCGGCAGAGCGCGATTCAGGGCTTCTTAGTGGAAGATCCAAAAAGGATCAAATAACGGATCATATGATCTGAATCTCTCTGGTTTTGAGAAAGGAGATACCGCTCGCCGCAGCCGAACGGCAGGAGCGTAGCGACTGAGTGAGCGAGGAAGCGGAATTTTTGCGATGTGACATTAGGATCAGTACGCACGAATATTATATTTATTTCAATAAGTTAAAGTTAACTAGGGACAAATTTATGGTCTTGAAAATTGAGATACATAAGGCATCAAATATTTTTTTGATGATTTTATGTTATTGAAAGTTATGAGTTTTAATGATTGATGATGTTTGTTTTAGCTTGCGGGTAATAATCATCGGGGGACAGATTTATGGTAAGGAACCATCATCGTTGCTGGTTTTGTTGAGTTATCCACAGTTCCTGAATATTCGCACGCATTAAAAGCCTTATCTTTTCTTGTTTTTCTTAAAAACTTAAAAACTTAGAGTAGCTCTAATTTATTGATTTTAAGCGTGTTTTTTGTCTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTTAAACATGATAACTTCCTCGGTTAAACATGAGAGCTTCCTCGGTGATATCCACAAAATGTGTCATAAGAATACTAATTCGTTGTTCTTTCTGGTGAATCTATTTTGAATCTGTTGTTAATCTGCCTTGAATCCAGTGTGGATTTTGAGCATGGATTACCTTTGTGAGATAAATCACAGATATGAAACATGAGAAGATACTCGGTTAAACATGATATTGATTGTGTTGTAATATCATGTTTCTGGTGTTAAAGTCTGATTATCAAGAGTGTTGGAACAATGAGA
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif TAAACATGAGAGCTTCCTCGG
Motif GCGDAGCGMBDTACWGVGCGWSKNAGCG
Motif CGMACGMA
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The result of BLAST |
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