RefSeq NC_023069.1
DoriC accession number aORI10010264
OriC length 957 nt
OriC AT content 0.3312
The location of oriC region 537785..538742 nt
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OriC map
OriC sequences
TGCTTATATTATAACGAGAGAATGTTTTATAACAATTAACCCCCCAGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATAGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTTATTTCAACTGGAATTAAAGCTAGACCTAGTTATTACCTGGAAATAATGATTTGTATAATTGAGTTTTATTTATGTTACTAGATCATGTTTTATTTTTGTGTAAATAGATGATATACATAATTTATTTTGGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGTTCGGTTGGCATCCGAGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTGTGGGGTTAGGGGGTACCCCCTAACATCCCAAGTACACTTCCACGATCTTATCTAAGGGACCAATGTAATGTTCCTTTACGTCACCATCTTTACCCTTCTCTATGGAGTAAACATAATACTTGTTACCTCTCTGACGAATCTTATATTGTCCAGTGATGAAAGTCCTATAACCCATGATATTTGTTATACCATTTTAATAAAATAAGGTTTAACCGTACATGTATCTATAATGATTTATGAGATTGGAAGAAGAGGTTATAATCTCTGGTAATGTAAATTAAACTCCCCGGTTAATTCTTCTTAAAACTAAAAATTTTTAAAATATATTATTTTTTACCGTTTATATTAGGGCTCTTTGGCTTGTCATCTATGTTAGTTAAACAATCTCCAATGACTTCCTATGGATCCATGAATTTGTAACAACTTAACTTAGATTTTGATTAAATCCCAGGAAATAGTTAGGTTAAATTTTTCCAAGCATATCTTAAACATTCTTTTGTATTAGTAAAGGAAAATAGTAAGTTTTTAATTGACTATTGAAGTAATGCATCATT
TGCTTATATTATAACGAGAGAATGTTTTATAACAATTAACCCCCCAGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATAGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTTATTTCAACTGGAATTAAAGCTAGACCTAGTTATTACCTGGAAATAATGATTTGTATAATTGAGTTTTATTTATGTTACTAGATCATGTTTTATTTTTGTGTAAATAGATGATATACATAATTTATTTTGGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGTTCGGTTGGCATCCGAGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTGTGGGGTTAGGGGGTACCCCCTAACATCCCAAGTACACTTCCACGATCTTATCTAAGGGACCAATGTAATGTTCCTTTACGTCACCATCTTTACCCTTCTCTATGGAGTAAACATAATACTTGTTACCTCTCTGACGAATCTTATATTGTCCAGTGATGAAAGTCCTATAACCCATGATATTTGTTATACCATTTTAATAAAATAAGGTTTAACCGTACATGTATCTATAATGATTTATGAGATTGGAAGAAGAGGTTATAATCTCTGGTAATGTAAATTAAACTCCCCGGTTAATTCTTCTTAAAACTAAAAATTTTTAAAATATATTATTTTTTACCGTTTATATTAGGGCTCTTTGGCTTGTCATCTATGTTAGTTAAACAATCTCCAATGACTTCCTATGGATCCATGAATTTGTAACAACTTAACTTAGATTTTGATTAAATCCCAGGAAATAGTTAGGTTAAATTTTTCCAAGCATATCTTAAACATTCTTTTGTATTAGTAAAGGAAAATAGTAAGTTTTTAATTGACTATTGAAGTAATGCATCATT
TGCTTATATTATAACGAGAGAATGTTTTATAACAATTAACCCCCCAGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATAGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTTATTTCAACTGGAATTAAAGCTAGACCTAGTTATTACCTGGAAATAATGATTTGTATAATTGAGTTTTATTTATGTTACTAGATCATGTTTTATTTTTGTGTAAATAGATGATATACATAATTTATTTTGGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGTTCGGTTGGCATCCGAGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTGTGGGGTTAGGGGGTACCCCCTAACATCCCAAGTACACTTCCACGATCTTATCTAAGGGACCAATGTAATGTTCCTTTACGTCACCATCTTTACCCTTCTCTATGGAGTAAACATAATACTTGTTACCTCTCTGACGAATCTTATATTGTCCAGTGATGAAAGTCCTATAACCCATGATATTTGTTATACCATTTTAATAAAATAAGGTTTAACCGTACATGTATCTATAATGATTTATGAGATTGGAAGAAGAGGTTATAATCTCTGGTAATGTAAATTAAACTCCCCGGTTAATTCTTCTTAAAACTAAAAATTTTTAAAATATATTATTTTTTACCGTTTATATTAGGGCTCTTTGGCTTGTCATCTATGTTAGTTAAACAATCTCCAATGACTTCCTATGGATCCATGAATTTGTAACAACTTAACTTAGATTTTGATTAAATCCCAGGAAATAGTTAGGTTAAATTTTTCCAAGCATATCTTAAACATTCTTTTGTATTAGTAAAGGAAAATAGTAAGTTTTTAATTGACTATTGAAGTAATGCATCATT

ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AAVTCCCVGG

StartP-valueSite
6841.16e-07ATGTAAATTAAACTCCCCGGTTAATTCTTC
3712.30e-06GGCATCCGAGAGGTCCCGGGTTCAAATCCC
8463.34e-06GATTTTGATTAAATCCCAGGAAATAGTTAG
3844.42e-06TCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTG
385.41e-06TATAACAATTAACCCCCCAGTAAATCACCC

Motif TRSVCCTWTATHTCAACTGGAAATAAWG

StartP-valueSite
1008.71e-14GAATACTACCTGCCCCTTTATTTCAACTGGAATTAAAGCTAGACCTAG
3268.44e-11TAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGTTCGGTTGGC
2361.23e-10TAATTTATTTTGGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGG
531.42e-10CCCAGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATAGTATTATG
1291.52e-10GAATTAAAGCTAGACCTAGTTATTACCTGGAAATAATGATTTGTATAA

Motif GTCCASTG

StartP-valueSite
5519.89e-06ATCTTATATTGTCCAGTGATGAAAGTCC
3969.89e-06ATCCCGGCCGGTCCACTGTGGGGTTAGG

The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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