RefSeq | NC_015435.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010100 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 1009 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.663 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1839340..1840348 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
GATAAAAACAATATCATGATAAGATTACTAGTCTCAAATTTCTATCGTAGTATAAAAGGGTGTAACAGATAGTTGAAATAGAGGAGAGGAATACTTTTCTAATCGCCTACATAATCACTAATTGATATTTGTTAATAAATTAAAAATGTATTATTATTAAATATTGATTTTATTTCGTTTTTTCATGAACTCGAATTGCTATGGAACCATAAACTGATTATAACGCTTTCGATTGTAGAGATCGTAAGGACCCAATATTTTTATAGCTCCTTTAACACAGTTCGTTCTTTAGTCCTCCCGGTCTGATGCTACGGATATCAATAATCCCAACGCTTCCTATCACTCCCTACGTCTCGATATCTGAGAAGGCTAAACTAGAACGTGTTAATTCAAGGGTCCTATTTTGGAATAAAAAGAGTATCTCGATTTCTAATAATGTTCTAAATCATAAATCATAAACTTTGAAACTAATGATGTTACTTAATTCATCCTCAATAATCTGTTTAACCTTTGCCAACTTGTTGGTAATATCATGCGACCGTGCTTGACTCATAATTATATTTCTATTTACACTAAAAACGAATTTAATTGTTTGGAAGAAATTTTCATTTTTATGGATATAACTTCTTGTAATTTTATGGACCGGCCGGGATTTGAACCCGGGACCTTTCGGATGCCAACCGAACACTCTTCCAGGCTGAGCTACCGGCCCATATTTAGATCTGTAGATTCTGTTTATAAATCTACCATTTTATTCCCTAAACCGTGGAGAGGCCTACCCCTATACTTCTCCTGGAAACAGATTCACTTTAACTTAACTACAATCTATTATTATCTTTATACAAACCGTTCTTTTTTAAAAGGAAAAATCATAAACTTAGACCATTCTCCAGTGGAAACAGAGGGGTGGCTCACTTTATCTTAGATTCTCCAGTGGAAACAGAGGGGTTATTTACTCCCCGATTAAATATCTCAACCCTTAAAACGTGAAATGAAGAATGATATTTGT
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ORB
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif SYBGAAACMGWGGRGWKGCHTAC
Motif GWSCTVCCGG
Motif GCTAYGGA
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The result of BLAST |
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