RefSeq | NZ_CP020364.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010356 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 766 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.3812 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 579359..580124 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCTTATATTATAACGAGAGAATATTTTATAACAATTAACCCCCCGGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATGGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTCATTTCAACTGGAAATAAAGCTACATCTAACTACTAACTTAAAATAACGGTTTGTATAATTTAGTTTTATTTATGTCACTAGTTCGTGTTTTATTTTTATGTAAATAATTGGTGTTCATATTTTATTTTTAGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGCGTGGTTGGCATCCACGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTCTTTTGTACTACTCCTTACGGTAGTCCTCTAATATAGAGTGCGCATTTCGAAACTGGCTCTGCACCACCGTTTATTCCGTGTAGCCAGAAAGTTCCTTTCACAGCAGATTTTGATTACTAGACGCTTACGCTTATTTCCTAAAGATAAGGAGCTAGAAAGGAGTACGAGAGTGTGCTAGGCTAAGTCGAGAGCAGGAAAAGGGGATCCGACTAGGCTCGTAATTGCGCAAGGCCATACGAGTTCTGGAAGATATTGCTCGTTGAATATTGAAAGTACCACTACTATTAAGTCAAAACTGTACTACAATATTAGATATTATGAAAACATTCTTAAATCATTGAACTAGTCAAACTTGTGGTATC
TGCTTATATTATAACGAGAGAATATTTTATAACAATTAACCCCCCGGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATGGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTCATTTCAACTGGAAATAAAGCTACATCTAACTACTAACTTAAAATAACGGTTTGTATAATTTAGTTTTATTTATGTCACTAGTTCGTGTTTTATTTTTATGTAAATAATTGGTGTTCATATTTTATTTTTAGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGCGTGGTTGGCATCCACGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTCTTTTGTACTACTCCTTACGGTAGTCCTCTAATATAGAGTGCGCATTTCGAAACTGGCTCTGCACCACCGTTTATTCCGTGTAGCCAGAAAGTTCCTTTCACAGCAGATTTTGATTACTAGACGCTTACGCTTATTTCCTAAAGATAAGGAGCTAGAAAGGAGTACGAGAGTGTGCTAGGCTAAGTCGAGAGCAGGAAAAGGGGATCCGACTAGGCTCGTAATTGCGCAAGGCCATACGAGTTCTGGAAGATATTGCTCGTTGAATATTGAAAGTACCACTACTATTAAGTCAAAACTGTACTACAATATTAGATATTATGAAAACATTCTTAAATCATTGAACTAGTCAAACTTGTGGTATC
TGCTTATATTATAACGAGAGAATATTTTATAACAATTAACCCCCCGGTAAATCACCCCTTTATTTCAACTGGAAAACTAATGGTATTATGAATACTACCTGCCCCTTCATTTCAACTGGAAATAAAGCTACATCTAACTACTAACTTAAAATAACGGTTTGTATAATTTAGTTTTATTTATGTCACTAGTTCGTGTTTTATTTTTATGTAAATAATTGGTGTTCATATTTTATTTTTAGATATATGTCTCCAGTGGAACTAAAGGGGTCTCTGGTTTTGGATTAAGGCGATAAAAAATTAATATCAGTGATCTACGTAGTATATTGTGGGCCGGTAGCTCAGCCTGGAAGAGTGCGTGGTTGGCATCCACGAGGTCCCGGGTTCAAATCCCGGCCGGTCCACTCTTTTGTACTACTCCTTACGGTAGTCCTCTAATATAGAGTGCGCATTTCGAAACTGGCTCTGCACCACCGTTTATTCCGTGTAGCCAGAAAGTTCCTTTCACAGCAGATTTTGATTACTAGACGCTTACGCTTATTTCCTAAAGATAAGGAGCTAGAAAGGAGTACGAGAGTGTGCTAGGCTAAGTCGAGAGCAGGAAAAGGGGATCCGACTAGGCTCGTAATTGCGCAAGGCCATACGAGTTCTGGAAGATATTGCTCGTTGAATATTGAAAGTACCACTACTATTAAGTCAAAACTGTACTACAATATTAGATATTATGAAAACATTCTTAAATCATTGAACTAGTCAAACTTGTGGTATC
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif CCCTTHATTBCRHVTGGMMA
Motif CCSSCCGG
Motif CGAGAG
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|