RefSeq NC_012550
DoriC accession number pORI00000172
OriC length 816 nt
OriC AT content 0.6005
The location of oriC region 3434..4249 nt
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OriC map
OriC sequences
TTTAAAATCCTCTTAAGTTTATTTTTACGACACGTCTGTCGCTACATAATTATACGAACATATGTTCGATTAAATTCTATATCTAATTAATTAAATTTGCAAATTAACGTACCAAAATTTTTGGTGAAGAAGGGGCACCGATTGTCACATCTAGTTGATTGACAAGGCAACATCGATCGCTTTTCATAGATGTTGCCAAATAGGTAATCGGCTATTTTTGTGGGGAGTTAAGAGGGGAGCGTAGCGCCCTTCTTACAAGCCATTTGCCAGACAATTAGGGAGCGTAGCGATACCTAATTGTCTAGCAAATGAACTGCTTGCCTAAAACCAAAAAGAGCACGACGAAGAAGTCGCCAAACGAGCTTAGAACGCAAAGTATGGCCTTTTATGCCTATCTGGGCTTACCTGCCGAGCGTCAGTCGAGGCTTTTCCTGAACCACGCTTTTGATTTTGAATTTAGCGAGTGAACGAAGTGAACGCTGCAAACAAAATGTGAGCGTGATTTTCGCTCACTCCTTTTTGGTTTTTGGTCCTGATTTGGCATTTTGGGGCACGGAGACGAAGTCGGAGATCCCCGCCTCTTATATAACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAGGGGGTGTTCTACCTTACTCTCCCAAGGGGTACAGGATGATTAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGTTAATTTGGGCATGAAATCCTTTTATATATGCTATAATAATTTTGAGGTGATTAT
TTTAAAATCCTCTTAAGTTTATTTTTACGACACGTCTGTCGCTACATAATTATACGAACATATGTTCGATTAAATTCTATATCTAATTAATTAAATTTGCAAATTAACGTACCAAAATTTTTGGTGAAGAAGGGGCACCGATTGTCACATCTAGTTGATTGACAAGGCAACATCGATCGCTTTTCATAGATGTTGCCAAATAGGTAATCGGCTATTTTTGTGGGGAGTTAAGAGGGGAGCGTAGCGCCCTTCTTACAAGCCATTTGCCAGACAATTAGGGAGCGTAGCGATACCTAATTGTCTAGCAAATGAACTGCTTGCCTAAAACCAAAAAGAGCACGACGAAGAAGTCGCCAAACGAGCTTAGAACGCAAAGTATGGCCTTTTATGCCTATCTGGGCTTACCTGCCGAGCGTCAGTCGAGGCTTTTCCTGAACCACGCTTTTGATTTTGAATTTAGCGAGTGAACGAAGTGAACGCTGCAAACAAAATGTGAGCGTGATTTTCGCTCACTCCTTTTTGGTTTTTGGTCCTGATTTGGCATTTTGGGGCACGGAGACGAAGTCGGAGATCCCCGCCTCTTATATAACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAGGGGGTGTTCTACCTTACTCTCCCAAGGGGTACAGGATGATTAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGTTAATTTGGGCATGAAATCCTTTTATATATGCTATAATAATTTTGAGGTGATTAT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GGAATTGTCTGTTTAAAGGCA

StartP-valueSite
7395.89e-13TTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGTTAATTTG
7175.89e-13TTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTC
6955.89e-13TTAAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTC
6735.89e-13ATTAAGGCATGGAATTGTCTGTTTAAAGGCATGGAATTGTC

Motif AAAWCCTCTT

StartP-valueSite
6101.21e-06AACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAGGGGGT
5981.21e-06AACCTCTTTTAAAACCTCTTTTAAAACCTC
52.60e-06TTTAAAATCCTCTTAAGTTTATTT
5863.99e-06CGCCTCTTATATAACCTCTTTTAAAACCTC
7761.02e-05TTTGGGCATGAAATCCTTTTATATATGCTA

Motif GGGMRCGDAGHG

StartP-valueSite
2781.73e-07CAGACAATTAGGGAGCGTAGCGATACCTAATT
2351.73e-07GAGTTAAGAGGGGAGCGTAGCGCCCTTCTTAC
5492.06e-06TGGCATTTTGGGGCACGGAGACGAAGTCGGAG
4644.25e-06AATTTAGCGAGTGAACGAAGTGAACGCTGCAA
1335.44e-06GGTGAAGAAGGGGCACCGATTGTCACATCTAG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000172 100.0 816 0 0 1 816 1 816 0.0 1507
pORI00000172 100.0 52 0 0 710 761 666 717 4.64e-21 97
pORI00000172 100.0 52 0 0 666 717 710 761 4.64e-21 97
pORI00000172 100.0 30 0 0 732 761 666 695 7.87e-09 57
pORI00000172 100.0 30 0 0 666 695 732 761 7.87e-09 57
pORI00000123 89.655 406 39 3 349 753 2 405 0.0 514
pORI00000934 89.82 167 13 4 362 526 457 621 0.0 211
pORI00000934 81.481 189 32 3 566 753 628 814 9.76e-38 152
pORI00000375 89.247 93 10 0 429 521 426 334 3.56e-27 117
pORI00000376 96.923 65 2 0 456 520 648 712 5.96e-25 110
pORI00000208 90.361 83 7 1 440 521 1074 1156 2.14e-24 108
pORI00000007 95.455 66 3 0 456 521 1088 1153 7.7e-24 106