RefSeq NC_004947
DoriC accession number pORI00000375
OriC length 945 nt
OriC AT content 0.6614
The location of oriC region 3057..4001 nt
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OriC map
OriC sequences
AATTTTATCCTTTCAAAACTAATATGATTTCAGTATACCATATTAGTTATTAATAGAATAGTAAAAAATAATATACAATTGATTTTTACTATTGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGTATTATCCTCGTAAACCTTGCTGTTAAGCCAATCTCATTTCCCTAAGTATTATAAAGTATTAAAGAATTATAAAGGAAATATAAAAGCGCGCGTAGGCGTGTGTTTTGTTTCTCTATTCTAAAAAAAAACAACACAAGCAAAAAAAAATAAAAAAAGGAGTGAGCGAAAATCATGCTCACATTTTACTTGCAGCGTTCACTTCGTTCACTCGCTAAGGGCAAAATCAAAACCGTCTTTAAGGAACTGGGGGGTAGGGCTAGAAGCTTGTATTTTTCGTTCTAAGCGACTTTAGACGCAACCCTAAGTCTTTCTTGCTAAGGCTCACTCCGTTCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCGTAGAGCTATGTAGAGCTATTTAGTTAAGATATTTCAAGCATTACTCCGCTTATCTTGTAAATAAGGCAATATAAAGCCGTATAAGCGACGTTCAACTATTAGTGGATGAATTACATTAGAAATGATTTAAAATGCCTTAGAACGCAAAATATGACGTTCTAGGACTATTCAAAACAAAAAGAGAGCTAAACATTTTTTGTTTAGCTCTCTTTTTGTTTTCCTCATCGGTTTGCTCGATGACAGGAGCAGTCAGATTGAAAATCTGAAATATATTCAAATTATTTTCCTAAGGGCGCACTTATACTCCCTAAATTTCATTTAGTGGTGATTGTGTTATAAAACTTAATTTACATTTCGTTTTATTGTCAGGCGTGTTGGTTAAAACTCACTCTGTTCGTGTGATAAT
AATTTTATCCTTTCAAAACTAATATGATTTCAGTATACCATATTAGTTATTAATAGAATAGTAAAAAATAATATACAATTGATTTTTACTATTGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGTATTATCCTCGTAAACCTTGCTGTTAAGCCAATCTCATTTCCCTAAGTATTATAAAGTATTAAAGAATTATAAAGGAAATATAAAAGCGCGCGTAGGCGTGTGTTTTGTTTCTCTATTCTAAAAAAAAACAACACAAGCAAAAAAAAATAAAAAAAGGAGTGAGCGAAAATCATGCTCACATTTTACTTGCAGCGTTCACTTCGTTCACTCGCTAAGGGCAAAATCAAAACCGTCTTTAAGGAACTGGGGGGTAGGGCTAGAAGCTTGTATTTTTCGTTCTAAGCGACTTTAGACGCAACCCTAAGTCTTTCTTGCTAAGGCTCACTCCGTTCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCGTAGAGCTATGTAGAGCTATTTAGTTAAGATATTTCAAGCATTACTCCGCTTATCTTGTAAATAAGGCAATATAAAGCCGTATAAGCGACGTTCAACTATTAGTGGATGAATTACATTAGAAATGATTTAAAATGCCTTAGAACGCAAAATATGACGTTCTAGGACTATTCAAAACAAAAAGAGAGCTAAACATTTTTTGTTTAGCTCTCTTTTTGTTTTCCTCATCGGTTTGCTCGATGACAGGAGCAGTCAGATTGAAAATCTGAAATATATTCAAATTATTTTCCTAAGGGCGCACTTATACTCCCTAAATTTCATTTAGTGGTGATTGTGTTATAAAACTTAATTTACATTTCGTTTTATTGTCAGGCGTGTTGGTTAAAACTCACTCTGTTCGTGTGATAAT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GTGGTGTGTATTTTACTATGG

StartP-valueSite
1627.31e-13TTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGTATTATCCTC
1407.31e-13TTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGT
1187.31e-13TTACTATGGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGT
967.31e-13TTACTATTGAGTGGTGTGTATTTTACTATGGAGTGGTGTGT

Motif CDKKCGGTWAGGGCAADMWC

StartP-valueSite
5111.96e-12AGGCTCACTCCGTTCGGTCAGGGCAAGCCCTAACAACCGT
3892.69e-09TCACTTCGTTCACTCGCTAAGGGCAAAATCAAAACCGTCT
4275.87e-09CTTTAAGGAACTGGGGGGTAGGGCTAGAAGCTTGTATTTT
1996.22e-09CCTCGTAAACCTTGCTGTTAAGCCAATCTCATTTCCCTAA

Motif AARRAAATAWAAARVSGHRTRWRSG

StartP-valueSite
2551.90e-12AAGAATTATAAAGGAAATATAAAAGCGCGCGTAGGCGTGTGTTTT
6023.61e-12TCTTGTAAATAAGGCAATATAAAGCCGTATAAGCGACGTTCAACT
3242.67e-11ACACAAGCAAAAAAAAATAAAAAAAGGAGTGAGCGAAAATCATGC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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pORI00000026 94.22 173 9 1 668 840 747 576 0.0 263
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pORI00000172 89.247 93 10 0 334 426 521 429 4.14e-27 117
pORI00000934 92.405 79 6 0 334 412 616 538 5.35e-26 113