RefSeq NC_018706.1
Accession number NC_018706.1
DoriC accession number ORI96010325
OriC length 670 nt
OriC AT content 0.729851
The location of oriC region 240803..241472 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaaGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmh
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGGCTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAGTTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TTGTGRATAAMT

StartP-valueSite
3717.05e-08CTGATCCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATG
5051.81e-07AACAATTACTTTGTGCATAACTTTTAAATAAG
1674.04e-07TCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGTACAT
1908.26e-07TTTGTACATCCTGTGGATAAATTATCACATAA
1391.68e-06AAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAA

Motif TSCWSAWKAAAAKBSSDSACY

StartP-valueSite
531.08e-11GATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCA
2942.02e-10AACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATA
6182.35e-10GCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAA

Motif TGWCWGCG

StartP-valueSite
131.47e-06GTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTC
6037.44e-06GGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010325 100.0 670 0 0 1 670 1 670 0.0 1238
ORI92710458 99.851 670 1 0 1 670 670 1 0.0 1232
ORI92310381 99.701 670 2 0 1 670 670 1 0.0 1227
ORI92710456 99.552 670 1 2 1 670 1 668 0.0 1219
ORI96010208 99.403 670 3 1 1 670 669 1 0.0 1214
ORI96010015 99.403 670 3 1 1 670 1 669 0.0 1214
ORI96010013 99.106 671 4 2 1 670 1 670 0.0 1205
ORI92310379 98.51 671 9 1 1 670 671 1 0.0 1182
ORI92510414 99.351 616 4 0 1 616 1 616 0.0 1116
ORI96010089 99.351 616 3 1 1 616 1 615 0.0 1114
ORI95010947 86.969 683 74 8 1 670 681 1 0.0 754
ORI93010694 86.715 685 72 12 1 670 681 1 0.0 743
ORI10010111 76.508 630 112 29 57 669 612 2 0.0 311