RefSeq | NC_010400.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession number | NC_010400.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lineage | bacteria, proteobacteria, gammaproteobacteria, pseudomonadales, moraxellaceae, acinetobacter. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | ORI92310379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 671 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.733234 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 3421650..366 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmhATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaa
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAATAATTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTCTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCATAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAATTTTAAAATTTATTCTTATTAGCGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCATAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
5'-DnaA box-3'
3'-DnaA box-5'
Spacer
DnaA-trio
ATP-DnaA box
AT-rich region GATC   CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AKTTATHCACAA
Motif RGYSHSSVMTTTTMWTSWGSA
Motif ACGCWGWCA
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of genes on leading or lagging strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|