RefSeq NC_014259.1
Accession number NC_014259.1
DoriC accession number ORI93010694
OriC length 681 nt
OriC AT content 0.722467
The location of oriC region 4152186..323 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif AKTTATHCACAAR

StartP-valueSite
5034.49e-08TTGTGCAAAAAGTTATACACAAGTGGTTTTGAA
2997.10e-08CATATTTTGTAGTTATCCACAAAAGATCACATC
4801.74e-07TTGTGTGATAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAA
1652.38e-07TAGTTTTTAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCT
5316.64e-07TTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGTTTTCTTT

Motif SRRWTGTKGATAASTTTGT

StartP-valueSite
4215.88e-11ACATATGTTTGGGTTGTTGATAACTCTGTTTTTATTATA
4552.37e-10TTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTGTGTGATAATTT
5832.45e-10TTCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCG

Motif KAAAAWCSMAAAAA

StartP-valueSite
41.89e-08ATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCT
715.94e-08CGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATT
6561.98e-07TGTTTGAATTTAAAAACGCAAAAATAGGGGATAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93010694 100.0 681 0 0 1 681 1 681 0.0 1258
ORI95010947 93.558 683 40 4 1 681 1 681 0.0 1014
ORI96010208 86.861 685 70 12 1 681 1 669 0.0 749
ORI96010015 86.861 685 70 12 1 681 669 1 0.0 749
ORI92710458 86.861 685 71 12 1 681 1 670 0.0 749
ORI96010325 86.715 685 72 12 1 681 670 1 0.0 743
ORI96010013 86.735 686 70 14 1 681 670 1 0.0 743
ORI92310381 86.715 685 72 12 1 681 1 670 0.0 743
ORI92710456 86.715 685 70 14 1 681 668 1 0.0 741
ORI92310379 86.152 686 75 15 1 681 1 671 0.0 723
ORI96010089 85.737 631 70 12 55 681 615 1 0.0 649
ORI92510414 85.737 631 71 12 55 681 616 1 0.0 649
ORI10010111 80.711 394 62 13 274 660 262 648 0.0 294