RefSeq | NC_017162.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession number | NC_017162.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lineage | bacteria, proteobacteria, gammaproteobacteria, pseudomonadales, moraxellaceae, acinetobacter, acinetobacter calcoaceticus/baumannii complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | ORI96010013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 670 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.734328 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 17714..18383 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaaGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmh
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
dnaAGTGTATCCCCTATGTCTGCGTTTTAAATTCAAATCATTTAAAGATTAACCCTTCCTGATGAGAAGGGGTCGCCATTCTACCCAAGTTATCCACATCTGTCATGACGATTTCGTTTGATTTTGCCTAAAAAGAAATCTCTTGTGAATAAATTTAAATTCAAAATCAATTGTGAATAACTTTTTGCACATCCTGTGGATAAATTATCACATAAACTTATCCACAATCCATAAAGACAATAAAAACAGAGTTATCAACAGTTCAAATATATGTTTTTTTAAATTTAAAACTGTGAAATCCACAAGAAAAGTCCACACTAATAAGAATAAATTTAAATTTTAAAATTTGAATTTATTTAATAGGCTGATTCAAATTGTGGATAACTAAAAAATATGAATTTAAATTCAAATATACCAAATCAAAACCAACTTCACATCAAGGTTTGTTGATAAGTATGTAAATAAGAAGTGTATATCTTAAAAGTCTTAATAAAAATAAACAATTACTTTGTGTATAACTTTTAAATAAGAAAAATAGGCTAAATATAAAGAGAAGATAAAAAATTAAAAATTTGACTTAAATACAAAACTTTCACGGTTTTTCATTGACAGCGTAAACATTGCACAATAAAATCGCGGACCTTTATAGAAAGATCATTTTTGGGAGTTTCGATrpmH
5'-DnaA box-3'
3'-DnaA box-5'
Spacer
DnaA-trio
ATP-DnaA box
AT-rich region GATC   CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif TTGTGDATAAMT
Motif TSCWSAWKAAAAKBSSDSACY
Motif TGWCWGCG
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of genes on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|