RefSeq | NC_016603.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession number | NC_016603.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lineage | bacteria, proteobacteria, gammaproteobacteria, pseudomonadales, moraxellaceae, acinetobacter, acinetobacter calcoaceticus/baumannii complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | ORI95010947 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 681 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.722467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 2626910..2627590 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmhATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaa
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
rpmHATTGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCAAGAAAGTTTTGTATTTAACCCAAATTTTTAATCTCTTCTCTTCTTTTTATCACGATCATAATTCAGTGCAATATATAGCTTTAAAAGTTATACACAAAGTAATTGTCTATTTTTATTAGAACTTTTAATATATACACACCTTATATACATATTTATCAACAAAACAAGATACCATCTTGGTTTGGATTTGCTGTATTTGAATTTAAATTCATATTTTGCAGTTATCCACAAAAGATCACCACCCTATTAAATAAATTCAAATTTAGAAATTTAAATTTATTCTTATTAGGGATAACTTTTTCTGTGGATTTCGCACTTTTAAATTTAAAAAACATACATTTGAGTTGTTGATAACTCTGTTTTTACTATATTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGTTAATTTATCCACAGGTTGTGCAAAAAGTTATACACAAGCCATTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGACAAAATCAACTGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGTTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGATTAATCTTTAGATTATTTGAATTTAAAAACGCAGAAATAGGGGATACACdnaA
5'-DnaA box-3'
3'-DnaA box-5'
Spacer
DnaA-trio
ATP-DnaA box
AT-rich region GATC   CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AAKTTATHCACAAR
Motif TGTGGATAACTY
Motif SRCSACCC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of genes on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|