RefSeq NC_017453.1
Accession number NC_017453.1
DoriC accession number ORI96010091
OriC length 433 nt
OriC AT content 0.819861
The location of oriC region 1892249..1892681 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaa
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
-TAGAAAATAATATTTTTATTTTATTAACATTTATTATAGAGAAAAAATTTTTTTATGTTTTTGAATTTATTTTCTTTTACTTATTAATATATAGACTTTATTTTCTTTTTTATATTATTATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGATTGCTTATTTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTGRATA

StartP-valueSite
1849.94e-06ATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATG
2432.97e-05TAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATC
1432.97e-05GTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAA
1297.35e-05TATTTATTATGTGAGTATTTTGTTGTG
2901.61e-04TAACATATTTGTGAATAACTTATTAAA

Motif CARATATATWARS

StartP-valueSite
1953.13e-08TGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAA
1711.66e-07AATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAA
2711.38e-06AATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGA

Motif GCYTAC

StartP-valueSite
4261.23e-05TGATAGTTTTGCCTACAT
3576.76e-05TTATCCACAGGCTTACTTAATTATGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010091 100.0 433 0 0 1 433 1 433 0.0 800
ORI95011019 100.0 433 0 0 1 433 25 457 0.0 800
ORI95011016 100.0 433 0 0 1 433 25 457 0.0 800
ORI30010209 100.0 433 0 0 1 433 1 433 0.0 800
ORI10010137 100.0 433 0 0 1 433 1 433 0.0 800
ORI90010280 99.083 436 1 2 1 433 1 436 0.0 780
ORI96010350 97.045 440 6 3 1 433 1 440 0.0 734
ORI96010349 97.045 440 6 3 1 433 1970 2409 0.0 734
ORI92210344 97.045 440 6 3 1 433 25 464 0.0 734
ORI30010222 97.045 440 6 3 1 433 1 440 0.0 734
ORI10010185 97.045 440 6 3 1 433 1 440 0.0 734
ORI92310406 96.544 434 14 1 1 433 1 434 0.0 717
ORI96030525 96.11 437 13 2 1 433 1 437 0.0 710
ORI60010251 95.195 437 17 2 1 433 1 437 0.0 688
ORI96010090 84.966 439 57 7 1 432 1 437 0.0 436
ORI96010215 84.0 425 52 13 1 416 1 418 0.0 394
ORI94010886 81.49 443 62 16 1 431 1 435 0.0 346
ORI92310371 80.59 407 58 16 35 428 1 399 0.0 294