RefSeq NC_010677.1
Accession number NC_010677.1
DoriC accession number ORI92310406
OriC length 563 nt
OriC AT content 0.79929
The location of oriC region 1893453..129 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif YGTGGR

StartP-valueSite
5442.33e-05GAGTATAAGACGTGGATAAAGCCTAT
1842.33e-05AATATCAAAGCGTGGATGAAAACAGA
1434.39e-05AGTATTTTGTTGTGGGTAACTTTTTA
4876.22e-05ATTATGACTACATGGGATAAATGTTT
2431.39e-04TTAATAAAAATGTGGATAAAAAAATA

Motif KSYTATCC

StartP-valueSite
5546.02e-07CGTGGATAAAGCCTATCCAT
4371.26e-06GCCTACATTTGGCTATCCTTTATATTTT
4022.09e-05TGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTAA

Motif AAMAYAATAAAMAAVCNBTTWAC

StartP-valueSite
2971.43e-10ATTTGTGAATAACATATTAAACAAGCAGTTGACCAAATAATAA
3411.82e-10CAAATTAATTAACACAATTATCCACAGGCTTACTTAATTATGA
5071.46e-08ATGTTTAAAAAAAATAAAAAAAAACCTTTCTACGTTTGAGTAT
2151.92e-08AAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAATGTGG
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92310406 100.0 563 0 0 1 563 1 563 0.0 1040
ORI92210344 96.309 569 15 2 1 563 25 593 0.0 929
ORI96030525 95.23 566 24 2 1 563 1 566 0.0 893
ORI90010280 96.881 481 13 2 1 479 1 481 0.0 804
ORI96010350 95.67 485 15 2 1 479 1 485 0.0 774
ORI96010349 95.67 485 15 2 1 479 1970 2454 0.0 774
ORI30010222 95.67 485 15 2 1 479 1 485 0.0 774
ORI10010185 95.67 485 15 2 1 479 1 485 0.0 774
ORI96010091 96.544 434 14 1 1 434 1 433 0.0 717
ORI95011019 96.544 434 14 1 1 434 25 457 0.0 717
ORI95011016 96.544 434 14 1 1 434 25 457 0.0 717
ORI30010209 96.544 434 14 1 1 434 1 433 0.0 717
ORI10010137 96.544 434 14 1 1 434 1 433 0.0 717
ORI60010251 93.568 482 28 2 1 479 1 482 0.0 715
ORI96010090 84.33 485 68 7 1 479 1 483 0.0 468