RefSeq NC_017909.1
Accession number NC_017909.1
DoriC accession number ORI96010215
OriC length 463 nt
OriC AT content 0.829374
The location of oriC region 1846740..1847202 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TATCAACA

StartP-valueSite
3507.46e-06TTAACATAATTATCCACAGGCTTGATTA
2794.00e-05TCAACAAAAATATCAACATATTTGTGAA
2674.00e-05TTATCAAATTTATCAACAAAAATATCAA
3061.14e-04ATAAGTTATTTAACAACATTCTTATCAA
1711.14e-04AAGCTATATATATCAAGAATTAAAGAGG

Motif TGTGGR

StartP-valueSite
1301.06e-05TTATTTATTATGTGGGTATTTTCTTG
2445.79e-05TGAATAAAAATGTGGATAAACAATTA

Motif GGYTTG

StartP-valueSite
3581.08e-05ATTATCCACAGGCTTGATTAATTATG
1876.56e-05GAATTAAAGAGGTTTGTAATAAATGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010215 100.0 463 0 0 1 463 1 463 0.0 856
ORI94010886 88.248 468 47 7 1 463 1 465 0.0 553
ORI92310371 88.018 434 45 5 34 463 1 431 0.0 507
ORI90010280 84.706 425 52 12 1 418 1 419 0.0 412
ORI96030525 84.186 430 52 15 1 421 1 423 0.0 403
ORI60010251 84.186 430 52 14 1 421 1 423 0.0 403
ORI96010091 84.0 425 52 13 1 418 1 416 0.0 394
ORI95011019 84.0 425 52 13 1 418 25 440 0.0 394
ORI95011016 84.0 425 52 13 1 418 25 440 0.0 394
ORI30010209 84.0 425 52 13 1 418 1 416 0.0 394
ORI10010137 84.0 425 52 13 1 418 1 416 0.0 394
ORI96010090 82.166 471 71 11 1 463 1 466 0.0 392