RefSeq NC_009749.1
Accession number NC_009749.1
DoriC accession number ORI92210344
OriC length 485 nt
OriC AT content 0.82268
The location of oriC region 1890425..1890909 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTGGATAAM

StartP-valueSite
1497.81e-07GTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAA
1901.36e-06ATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTA
2503.95e-06TAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAA
2977.43e-06TAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACA

Motif CAGATWTATWARSA

StartP-valueSite
2013.39e-08TGGATGAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAAA
4615.74e-07TTTATATTTTAAGGGTTATTAGGATATTTTTTAT
3496.50e-07AATTAATTAACACATTTATCCACAGACTTACTTA
2789.93e-07AATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGAA

Motif RCMWWCATTTGRC

StartP-valueSite
4337.67e-10TAATAGTTTTGCCTACATTTGGCTATCCTTTAT
3131.36e-07AACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010350 100.0 485 0 0 1 485 1 485 0.0 896
ORI96010349 100.0 485 0 0 1 485 1970 2454 0.0 896
ORI92210344 100.0 485 0 0 1 485 25 509 0.0 896
ORI30010222 100.0 485 0 0 1 485 1 485 0.0 896
ORI10010185 100.0 485 0 0 1 485 1 485 0.0 896
ORI90010280 97.331 487 5 4 1 485 1 481 0.0 821
ORI96030525 95.893 487 13 2 1 485 1 482 0.0 782
ORI92310406 95.67 485 15 2 1 485 1 479 0.0 774
ORI60010251 95.072 487 17 2 1 485 1 482 0.0 760
ORI96010091 97.045 440 6 3 1 440 1 433 0.0 734
ORI95011019 97.045 440 6 3 1 440 25 457 0.0 734
ORI95011016 97.045 440 6 3 1 440 25 457 0.0 734
ORI30010209 97.045 440 6 3 1 440 1 433 0.0 734
ORI10010137 97.045 440 6 3 1 440 1 433 0.0 734
ORI96010090 85.918 490 57 8 1 485 1 483 0.0 512