RefSeq NC_016937.1
Accession number NC_016937.1
DoriC accession number ORI95011019
OriC length 457 nt
OriC AT content 0.818381
The location of oriC region 1892288..1892744 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTGGATAAM

StartP-valueSite
1679.48e-07GTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAA
2081.70e-06ATATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTA
2674.96e-06TAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAA
3149.07e-06TAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACA

Motif CCAMWRKC

StartP-valueSite
3759.81e-08ACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATT
1953.18e-05AATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGA

Motif GMYTRC

StartP-valueSite
4502.72e-05TGATAGTTTTGCCTACAT
3952.02e-04ACTTAATTATGATTGCTTATTTATTT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI95011019 100.0 457 0 0 1 457 1 457 0.0 845
ORI95011016 100.0 457 0 0 1 457 1 457 0.0 845
ORI96010091 100.0 433 0 0 25 457 1 433 0.0 800
ORI30010209 100.0 433 0 0 25 457 1 433 0.0 800
ORI10010137 100.0 433 0 0 25 457 1 433 0.0 800
ORI90010280 99.083 436 1 2 25 457 1 436 0.0 780
ORI96010349 97.198 464 6 3 1 457 1946 2409 0.0 778
ORI92210344 97.198 464 6 3 1 457 1 464 0.0 778
ORI96010350 97.045 440 6 3 25 457 1 440 0.0 734
ORI30010222 97.045 440 6 3 25 457 1 440 0.0 734
ORI10010185 97.045 440 6 3 25 457 1 440 0.0 734
ORI92310406 96.544 434 14 1 25 457 1 434 0.0 717
ORI96030525 96.11 437 13 2 25 457 1 437 0.0 710
ORI60010251 95.195 437 17 2 25 457 1 437 0.0 688
ORI96010090 84.966 439 57 7 25 456 1 437 0.0 436
ORI96010215 84.0 425 52 13 25 440 1 418 0.0 394
ORI94010886 81.49 443 62 16 25 455 1 435 0.0 346
ORI92310371 80.59 407 58 16 59 452 1 399 0.0 294