RefSeq NC_015696.1
Accession number NC_015696.1
DoriC accession number ORI94010886
OriC length 483 nt
OriC AT content 0.811594
The location of oriC region 2035595..146 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif AACAMATTWAWWWACAWAATTATBMAYABWTTTG

StartP-valueSite
3314.20e-16ACAAAAAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACAGGTCTGAGTAATTATG
1512.45e-12TCTTGTTGATAACTCTTTAAAACACAAATATATCAATAGATTTGAGTATTTTAC
2607.08e-12ATAATTAATCATCAAATTTATCAACAAAATTATTAACATATTTGTAAATAAGTT
4078.73e-12AATAAAATCTAACACATTCAATTAATCTATTATGCCTACTATTGGTTATCCTTT

Motif GTGGAT

StartP-valueSite
2466.33e-05GAATAAAAATGTGGATAATTAATCAT
2206.33e-05ATGTAAAAAAGTGGATGAAAGAGCCT
1316.33e-05TATTTATTATGTGGATATTTTCTTGT

Motif WGRGMC

StartP-valueSite
2293.03e-05AGTGGATGAAAGAGCCTGAATAAAAA
4675.76e-05TAAAGGTTATTGGGACATTTTTTTGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94010886 100.0 483 0 0 1 483 1 483 0.0 893
ORI96010215 88.248 468 47 7 1 465 1 463 0.0 553
ORI92310371 87.778 450 48 7 34 480 1 446 0.0 520
ORI96010090 82.957 487 68 14 1 479 1 480 0.0 425
ORI60010251 82.099 486 73 13 1 479 1 479 0.0 403
ORI96030525 81.893 486 74 14 1 479 1 479 0.0 398
ORI90010280 81.725 487 72 15 1 479 1 478 0.0 390
ORI96010091 81.49 443 62 16 1 435 1 431 0.0 346
ORI95011019 81.49 443 62 16 1 435 25 455 0.0 346
ORI95011016 81.49 443 62 16 1 435 25 455 0.0 346
ORI30010209 81.49 443 62 16 1 435 1 431 0.0 346
ORI10010137 81.49 443 62 16 1 435 1 431 0.0 346