RefSeq NC_009257.1
Accession number NC_009257.1
DoriC accession number ORI90010280
OriC length 481 nt
OriC AT content 0.819127
The location of oriC region 1898041..45 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTGRATAAMWTWTTAWMMAATHWATTDACMRATWTATWAAC

StartP-valueSite
2933.89e-16TAACATATTTGTGAATAACTTATTAAACAATCATTTGACCAAATAATAAACAAATTAATTA
1463.42e-15GTATTTTGTTGTGGATAACTTTTTAAAAAATATATATCCCAATATCTAAGCGTGGATGAAA
2461.27e-14TAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATCAAATTTATTAACAGATATATTAACATATTTGTGA
3943.33e-14TTATTTTTATTGCAATAAAATCTTATCCATTCAATTGATAGTTTTGCCTACATTTGGCTAT

Motif MMAMASSC

StartP-valueSite
3543.27e-07ACATAATTATCCACAGGCTTACTTAATT
2274.55e-05AAAACAATAAAAAAACCCTTAATAAAAA

Motif GGATGWAAAMARM

StartP-valueSite
1891.15e-08ATCTAAGCGTGGATGAAAACAGATGTATAAGGA
2091.11e-07AGATGTATAAGGATGTAAAAAACAATAAAAAAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI90010280 100.0 481 0 0 1 481 1 481 0.0 889
ORI96010350 97.331 487 5 4 1 481 1 485 0.0 821
ORI96010349 97.331 487 5 4 1 481 1970 2454 0.0 821
ORI92210344 97.331 487 5 4 1 481 25 509 0.0 821
ORI30010222 97.331 487 5 4 1 481 1 485 0.0 821
ORI10010185 97.331 487 5 4 1 481 1 485 0.0 821
ORI92310406 96.881 481 13 2 1 481 1 479 0.0 804
ORI96030525 96.687 483 13 3 1 481 1 482 0.0 800
ORI96010091 99.083 436 1 2 1 436 1 433 0.0 780
ORI95011019 99.083 436 1 2 1 436 25 457 0.0 780
ORI95011016 99.083 436 1 2 1 436 25 457 0.0 780
ORI30010209 99.083 436 1 2 1 436 1 433 0.0 780
ORI10010137 99.083 436 1 2 1 436 1 433 0.0 780
ORI60010251 95.859 483 17 3 1 481 1 482 0.0 778
ORI96010090 86.626 486 57 7 1 481 1 483 0.0 531
ORI96010215 84.706 425 52 12 1 419 1 418 0.0 412
ORI94010886 81.725 487 72 15 1 478 1 479 0.0 390
ORI92310371 80.568 458 69 17 35 481 1 449 0.0 335