RefSeq NC_008601.1
Accession number NC_008601.1
DoriC accession number ORI60010251
OriC length 482 nt
OriC AT content 0.815353
The location of oriC region 1909694..144 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTGRATA

StartP-valueSite
1851.29e-05CAATATCTAAGCGGGTATAAAAACAGA
2473.96e-05TAATAAAAATGTGGATAAAAAATTATC
1463.96e-05ACATTTTGCTGTGGATAACTTTTTAAA
1329.20e-05TATTTATTATGTGAACATTTTGCTGTG
2942.01e-04TAACATATTTGTGAATAACTTATTAAA

Motif GKYTWKCY

StartP-valueSite
3602.63e-06ATTATCCACAGGCTTGCTTAATTATGAT
4404.69e-06GCCTACATTTGGCTATCCTTTATATTTT
4252.14e-05TCAATTAATAGTTTTGCCTACATTTGGC

Motif CAGAKWTATTARSATA

StartP-valueSite
1981.42e-08GGTATAAAAACAGATGTATAAGGATGTAAAAAAACA
2752.85e-08AATTTATTAACAGAGATATTAACATATTTGTGAATA
4584.22e-08TTTATATTTTAAGGGTTATTAGGATATTTTTTATT
3341.61e-06AAAGAATAAACAAATTAATTAACATAATTATCCACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI60010251 100.0 482 0 0 1 482 1 482 0.0 891
ORI96030525 98.133 482 9 0 1 482 1 482 0.0 841
ORI90010280 95.859 483 17 3 1 482 1 481 0.0 778
ORI96010350 95.072 487 17 2 1 482 1 485 0.0 760
ORI96010349 95.072 487 17 2 1 482 1970 2454 0.0 760
ORI92210344 95.072 487 17 2 1 482 25 509 0.0 760
ORI30010222 95.072 487 17 2 1 482 1 485 0.0 760
ORI10010185 95.072 487 17 2 1 482 1 485 0.0 760
ORI92310406 93.568 482 28 2 1 482 1 479 0.0 715
ORI96010091 95.195 437 17 2 1 437 1 433 0.0 688
ORI95011019 95.195 437 17 2 1 437 25 457 0.0 688
ORI95011016 95.195 437 17 2 1 437 25 457 0.0 688
ORI30010209 95.195 437 17 2 1 437 1 433 0.0 688
ORI10010137 95.195 437 17 2 1 437 1 433 0.0 688
ORI96010090 88.041 485 53 4 1 482 1 483 0.0 569
ORI96010215 84.186 430 52 14 1 423 1 421 0.0 403
ORI94010886 82.099 486 73 13 1 479 1 479 0.0 403
ORI92310371 80.911 461 63 21 35 482 1 449 0.0 340