RefSeq NC_017338.1
Accession number NC_017338.1
DoriC accession number ORI96010072
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2810706..2811435 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.54e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.27e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.27e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.58e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.40e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6683.15e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6127.66e-09AAGCAGGATGAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAC
3939.36e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.15e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.52e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif ASCATGAG

StartP-valueSite
2821.22e-05TTTTGTTCGAAGCATGAGTGTTTACAAT
2641.22e-05TCATAACATCACCATGAGTTTTGTTCGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI93010600 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92210347 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92010319 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI90010305 98.767 730 9 0 1 730 259 988 0.0 1299
ORI10010066 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010035 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010019 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010017 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010086 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010198 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010084 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI10010177 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010070 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI95011013 98.219 730 12 1 1 730 1 729 0.0 1275
ORI96010082 98.082 730 14 0 1 730 1 730 0.0 1271
ORI96010078 98.082 730 14 0 1 730 730 1 0.0 1271
ORI96010076 98.082 730 14 0 1 730 1 730 0.0 1271
ORI96010068 98.082 730 14 0 1 730 1 730 0.0 1271