RefSeq NC_017351.1
Accession number NC_017351.1
DoriC accession number ORI96010086
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2846333..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.40e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.22e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.22e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.53e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6912.57e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6683.31e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6127.89e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAC
3938.96e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.19e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.55e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2787.67e-06TGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.61e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010086 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI93010600 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI92210347 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI92010319 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI90010305 99.863 730 1 0 1 730 259 988 0.0 1343
ORI10010066 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI10010035 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI10010019 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI10010017 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI96010198 99.315 730 5 0 1 730 1 730 0.0 1321
ORI95011011 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI92010323 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010184 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010182 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010031 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI96010084 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92210360 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010070 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010177 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299