RefSeq NC_017763.1
Accession number NC_017763.1
DoriC accession number ORI96010198
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2832086..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.56e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.25e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.25e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.57e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6912.61e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACTKMT

StartP-valueSite
6681.24e-09GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6126.36e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAAC
3935.69e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAC
4741.08e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.17e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2787.92e-06TGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.65e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010198 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010080 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI96010074 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI93010600 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI92210347 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI92010319 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI90010305 99.452 730 4 0 1 730 259 988 0.0 1327
ORI10010066 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI10010035 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI10010019 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI10010017 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI96010086 99.315 730 5 0 1 730 1 730 0.0 1321
ORI96010084 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI96010070 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI95011011 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92010323 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010184 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010182 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010031 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92210360 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI10010177 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293