RefSeq NC_017333.1
Accession number NC_017333.1
DoriC accession number ORI96010068
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2872369..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTDTGDAWAAGTTATCCAMYKMTK

StartP-valueSite
6602.41e-11TTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGT
5225.44e-11AAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAA
6041.38e-10TAACTACTAAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAACT
3858.56e-10GATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATA
3008.65e-09TGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAATTCTTATACATACTT

Motif TGTGGATAAYTAWWAA

StartP-valueSite
4301.61e-08TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAA
5883.82e-08ATAAAAATACTGTGCATAACTACTAAGCAGGATAAA
6381.36e-07GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGT
6912.78e-07CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAA
4971.32e-06GTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTG

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2788.01e-06TGATTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.72e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI90010305 98.767 730 9 0 1 730 259 988 0.0 1299
ORI10010066 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
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ORI10010019 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010017 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
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ORI96010082 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI96010078 98.356 730 12 0 1 730 730 1 0.0 1282
ORI96010076 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI96010066 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282
ORI10010033 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282