RefSeq NC_009782.1
Accession number NC_009782.1
DoriC accession number ORI92210347
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2879955..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.42e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.23e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.23e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.54e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.33e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6683.31e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6127.89e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAC
3938.96e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.18e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.55e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2787.62e-06TGAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.60e-05TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI96010074 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI92210347 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI90010305 100.0 730 0 0 1 730 259 988 0.0 1349
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ORI10010019 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI10010017 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010086 99.863 730 1 0 1 730 1 730 0.0 1343
ORI96010198 99.452 730 4 0 1 730 1 730 0.0 1327
ORI96010084 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI96010070 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI95011011 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92010323 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010184 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010182 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010031 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92210360 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010177 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304