RefSeq NC_007622.1
Accession number NC_007622.1
DoriC accession number ORI10010177
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2742318..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.42e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.24e-06GTTATTAATTTGTGGATAATTATTGACATGG
4301.24e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.54e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.32e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6683.17e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6127.69e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAT
3938.60e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.22e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.49e-06TTGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CACSATGMGA

StartP-valueSite
2331.28e-07GATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAAT
2639.10e-07TTCATAACATCACCATGAGATTGGTTCAAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI90010305 98.904 730 8 0 1 730 259 988 0.0 1304
ORI10010066 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010035 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010019 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI10010017 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010086 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
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ORI96010084 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010082 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010078 98.493 730 11 0 1 730 730 1 0.0 1288
ORI96010076 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010072 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010070 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010066 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI10010033 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288