RefSeq NC_017347.1
Accession number NC_017347.1
DoriC accession number ORI96010082
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2913687..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.24e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.19e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.19e-06TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.50e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.27e-06TTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AAGTTATCCACNGDT

StartP-valueSite
6126.29e-10AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGGTTGTTATTAAC
6685.13e-09GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGTTGTTATTTTTG
3931.57e-07ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACACTTAT
4742.19e-07TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA

Motif CACSATGMG

StartP-valueSite
2333.72e-07GATAGAAATACACGATGCGAGCAATCAAA
2632.66e-06TTCATAACATCACCATGAGTTTGATCCAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010082 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010076 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010066 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010078 99.726 730 2 0 1 730 730 1 0.0 1338
ORI10010033 99.726 730 2 0 1 730 1 730 0.0 1338
ORI96010084 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010080 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010074 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI93010600 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92210347 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI92010319 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI90010305 98.767 730 9 0 1 730 259 988 0.0 1299
ORI10010066 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010035 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010019 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010017 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010086 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010070 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010198 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI10010177 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288
ORI96010068 98.356 730 12 0 1 730 1 730 0.0 1282