RefSeq NC_017342.1
Accession number NC_017342.1
DoriC accession number ORI96010078
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 519920..520649 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif ARTTATCCACA

StartP-valueSite
1984.97e-07GAGTTGGACGACTTATCCACACAATTATACT
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831.13e-06CCATGTTAATAATTATCCACAAGTTAATAAC
1331.43e-06CCTGCTTATTAGTTATGCACAGTATTTTTAT
303.15e-06TAAATTTTTAAGTTATACACAAAAATAACAA

Motif MAWMAGTGKATAACTT

StartP-valueSite
489.72e-10ACAAAAATAACAACCGTGGATAACTTCTAAACACAC
3235.43e-09TATAAGTGTGCATAAGTGGATAACTTTTCCTTCTAT
1048.40e-09AGTTAATAACAATCGGTGGATAACTTTATCCTGCTT
4089.43e-07AAGTATGTATAAGAACTGTATAAGGTGTTCAAACAT
2611.07e-06ATATGTTGCTAAAAATAGTATAACTTTGTGTGTAAT

Motif CTCATGST

StartP-valueSite
4425.69e-06ATTGTAAACACTCATGCTTTGGATCAAA
4601.22e-05TTGGATCAAACTCATGGTGATGTTATGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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ORI93010600 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI92210347 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI92010319 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI90010305 98.767 730 9 0 1 730 988 259 0.0 1299
ORI10010066 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI10010035 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI10010019 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI10010017 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
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ORI96010070 98.63 730 10 0 1 730 730 1 0.0 1293
ORI96010198 98.493 730 11 0 1 730 730 1 0.0 1288
ORI10010177 98.493 730 11 0 1 730 730 1 0.0 1288
ORI96010068 98.356 730 12 0 1 730 730 1 0.0 1282