RefSeq NC_016928.1
Accession number NC_016928.1
DoriC accession number ORI95011013
OriC length 729 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2788450..542 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5225.14e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6371.16e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4291.16e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5871.46e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6903.18e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACWKMT

StartP-valueSite
6673.29e-10GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6118.42e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACCGATTGTTATTAAC
3929.28e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4731.26e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3071.54e-06ATATTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CSCAAG

StartP-valueSite
1725.21e-05CTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTAT
3451.10e-04TAAATTATTTCCCAAGCTGTTTTGAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI95011013 100.0 729 0 0 1 729 1 729 0.0 1347
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ORI93010600 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI92210347 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI92010319 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI90010305 98.904 730 7 1 1 729 259 988 0.0 1303
ORI10010066 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI10010035 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI10010019 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI10010017 98.904 730 7 1 1 729 1 730 0.0 1303
ORI96010086 98.767 730 8 1 1 729 1 730 0.0 1297
ORI96010084 98.767 730 8 1 1 729 1 730 0.0 1297
ORI96010198 98.63 730 9 1 1 729 1 730 0.0 1291
ORI96010070 98.493 730 10 1 1 729 1 730 0.0 1286
ORI96010082 98.356 730 11 1 1 729 1 730 0.0 1280
ORI96010078 98.356 730 11 1 1 729 730 1 0.0 1280
ORI96010076 98.356 730 11 1 1 729 1 730 0.0 1280
ORI96010066 98.356 730 11 1 1 729 1 730 0.0 1280
ORI10010177 98.356 730 11 1 1 729 1 730 0.0 1280
ORI10010033 98.356 730 11 1 1 729 1 730 0.0 1280