RefSeq NC_017337.1
Accession number NC_017337.1
DoriC accession number ORI96010070
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2832265..516 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaa
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
-GCAAAACACCTCCATCTTTATACAGTTATCTAATATACCAGATTATGCAGACTCTGATCACTTTAATAGATAAGATTTTGCGTTTCTTAGATTAAAATTCTCGTATTAGCTCATTGATTATCTAGTCATAATTCAAGCAACTACTACAATATAACAAAATCCTTTTTATAACGCAAGTTCATTTTATACTACTGCTCAATTTTTTTACTTTTATCGATTAAAGATAGAAATACACGATGCAAGCAATCAAATTTCATAACATCACCATAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTTACAATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACTTTATAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATACACACACTAACAGATACTCTATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTATAGTTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACACACAAAGTTATACTATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATATAGAGAACTGAAAAAGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTCATGATTTTATAAGGATTTATTTATTGATATTTACATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGGTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTAAGAAAGATGGAGTAAATTTdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.06e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.16e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.16e-06TTTTTAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.46e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.19e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACTKMT

StartP-valueSite
6681.13e-09GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6125.90e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAAC
3935.60e-08ATAGAAGGAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.10e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.10e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CCSAAGC

StartP-valueSite
2787.09e-06TAAGTTTGGTCCGAAGCATGAGTGTTT
3461.50e-05TAAATTATTTCCCAAGCTATTTTGATA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010070 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
ORI96010198 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010084 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010080 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010074 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI93010600 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92210347 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI92010319 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI90010305 99.041 730 7 0 1 730 259 988 0.0 1310
ORI10010066 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010035 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010019 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI10010017 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010086 98.904 730 8 0 1 730 1 730 0.0 1304
ORI96010082 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010078 98.63 730 10 0 1 730 730 1 0.0 1293
ORI96010076 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010068 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010066 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI10010033 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293
ORI96010301 98.493 730 11 0 1 730 1 730 0.0 1288