RefSeq NC_017349.1
Accession number NC_017349.1
DoriC accession number ORI96010084
OriC length 730 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 2750621..516 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGGATAAYT

StartP-valueSite
5235.24e-07AGTATAATTGTGTGGATAAGTCGTCCAACTC
6381.19e-06GTTATTAACTTGTGGATAATTATTAACATGG
4301.19e-06TTTTCAGAATTGTGGATAATTAGAAATTACA
5881.50e-06ATAAAAATACTGTGCATAACTAATAAGCAGG
6913.27e-06CTGTTATTTTTGTGTATAACTTAAAAATTTA

Motif AASTTATCCACTKMT

StartP-valueSite
6681.23e-09GTGTGTTTAGAAGTTATCCACGGCTGTTATTTTTG
6126.34e-09AAGCAGGATAAAGTTATCCACTGATTGTTATTAAC
3936.08e-08ATAGAAGAAAAAGTTATCCACTTATGCACATTTAT
4741.10e-06TATTTTTAGCAACATATTCACAGGTATTTGACATA
3081.20e-06ATGTTTGAATACCTTATACAGTTCTTATACATACT

Motif CCKMASCATGAG

StartP-valueSite
2781.19e-08TGAGTTTGATCCGAAGCATGAGTGTTTACAAT
2603.42e-08AATTTCATAACCTCACCATGAGTTTGATCCGA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010084 100.0 730 0 0 1 730 1 730 0.0 1349
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ORI92010319 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI90010305 99.178 730 6 0 1 730 259 988 0.0 1315
ORI10010066 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010035 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010019 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI10010017 99.178 730 6 0 1 730 1 730 0.0 1315
ORI96010086 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010070 99.041 730 7 0 1 730 1 730 0.0 1310
ORI96010082 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010078 98.767 730 9 0 1 730 730 1 0.0 1299
ORI96010076 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI96010066 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI10010033 98.767 730 9 0 1 730 1 730 0.0 1299
ORI95011013 98.767 730 8 1 1 730 1 729 0.0 1297
ORI10010177 98.63 730 10 0 1 730 1 730 0.0 1293