RefSeq | GCF_000186665.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Accession number | NC_020547.2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Lineage | bacteria, proteobacteria, gammaproteobacteria, moraxellales, moraxellaceae, acinetobacter, acinetobacter calcoaceticus/baumannii complex. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | ORI97227096 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 670 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.726866 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 3704064..449 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmhATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaa
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
rpmHATCGAAACTCCCAAAAATGATCTTTCTATAAAGGTCCGCGATTTTATTGTGCAATGTTTACGCTGTCAATGAAAAACCGTGAAAGTTTTGTATTTAAGTCAAATTTTTAACTTTTTATCTTCTCTTTATATTTAGCCTATTTTTCTTATTTAAAAGTTATGCACAAAGTAATTGTTTATTTTTATTAAGACTTTTAAGATATACACTTCTTATTTACATACTTATCAACAAACCTTGATGTGAAGTTGGTTTTGATTTGGTATATTTGAATTTAAATTCATATTTTTTAGTTATCCACAATTTGGATCAGCCCTATTAAATAAATTCAAATTTTAAAATTTAAATTTATTCTTATTAGTGTGGACTTTTCTTGTGGATTTCACAGTTTTAAATTTAAAAAACATATATTTGAACTGTTGATAACTCTGTTTTTATTGTCTTTATGGATTGTGGATAAGTTTATGTGATAATTTATCCACAGGATGTGCAAAAAGTTATTCACAATTGGTTTTGAATTTAAATTTATTCACAAGAGATTTCTTTTTAGGCAAAATCAAACGAAATCGTCATGACAGATGTGGATAACTTGGGTAGAATGGCGACCCCTTCTCATCAGGAAGGGTTAATCTTTAAATGATTTGAATTTAAAACGCAGACATAGGGGATACACdnaA
5'-DnaA box-3'
3'-DnaA box-5'
Spacer
DnaA-trio
ATP-DnaA box
AT-rich region GATC   CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AKTTATYCACAA
Motif TGTGGA
Motif SASCCC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of genes on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|