RefSeq NC_006130
DoriC accession number pORI00000002
OriC length 1089 nt
OriC AT content 0.6492
The location of oriC region 2597..334 nt
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OriC map
OriC sequences
TTTGATACCCTTTCTAAATATTGACGACTACGATATATTAGTTGCTTTTAATTTGTTTGATAACTGTGATTTTCTATTTTAACTCCTTTCTATCTCAAACAAATTGTTTCCGCTTTCATTTTATGATATTTTATTTAGAAATTCAATAGCATTATAGGCTTTTAATTAAAAAATAACGGATTATTTTAACTTACATTGTATAATCATTAACTTAAGTAAAGATAGATTTTATTTCAGGCAAGCAACGGGTTTGTCATGACAAACCCAAAAACGTTGTTTTTGTCTTGTTAGGATTCTCCTAAAACCGTAATAAAAAAGATCAGCATTCGTTTAAAAATGCCGGTCTTTTTTTAATGTCATTATATTCGATTTTTTTACTCACTAGCGTTCGTATGATTCTATTTTGTTGTTGGAATAATTTCCAACAACAAAATAGAATAGCAATCATTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTTAGGCACCCTAACAAGTCGTTTAAGCGATTTGTGTATACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTAAAATGGCTTAGAAGGCAAATATGAGCCTTCTAAGAGGTTTTAGATATAAGCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCGGAGGCGGTTTGGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGACAAAGCAAGTATCACCGTCCCTGGTTTCTTGTTGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGGTATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGATGGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAATTTAACCTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAACACCTAGGTTGCCCCCTAGGTGTTTTCTTTATGCTTATATTTCTTGAACTTTTAAGCATCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAAGGTGTCAAAAAACTGCTTTTTGCTT
TTTGATACCCTTTCTAAATATTGACGACTACGATATATTAGTTGCTTTTAATTTGTTTGATAACTGTGATTTTCTATTTTAACTCCTTTCTATCTCAAACAAATTGTTTCCGCTTTCATTTTATGATATTTTATTTAGAAATTCAATAGCATTATAGGCTTTTAATTAAAAAATAACGGATTATTTTAACTTACATTGTATAATCATTAACTTAAGTAAAGATAGATTTTATTTCAGGCAAGCAACGGGTTTGTCATGACAAACCCAAAAACGTTGTTTTTGTCTTGTTAGGATTCTCCTAAAACCGTAATAAAAAAGATCAGCATTCGTTTAAAAATGCCGGTCTTTTTTTAATGTCATTATATTCGATTTTTTTACTCACTAGCGTTCGTATGATTCTATTTTGTTGTTGGAATAATTTCCAACAACAAAATAGAATAGCAATCATTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTTAGGCACCCTAACAAGTCGTTTAAGCGATTTGTGTATACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTAAAATGGCTTAGAAGGCAAATATGAGCCTTCTAAGAGGTTTTAGATATAAGCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCGGAGGCGGTTTGGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGACAAAGCAAGTATCACCGTCCCTGGTTTCTTGTTGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGGTATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGATGGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAATTTAACCTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAACACCTAGGTTGCCCCCTAGGTGTTTTCTTTATGCTTATATTTCTTGAACTTTTAAGCATCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAAGGTGTCAAAAAACTGCTTTTTGCTT

AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AGMWCYTTGWBSRWVHGMMVKRMMAASVHMKWVKTWSCSBMSBHGGTKT

StartP-valueSite
6383.58e-21ATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCGGAGGCGGTTTGGTCAGAACT
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6919.11e-20CGGTTTGGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGACAAAGCAAGTATCACCGTCCCTGGTTTCTTGTTGTCA

Motif SBCAAAMAAVTKGTTTDTG

StartP-valueSite
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Motif GCGACAAA

StartP-valueSite
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The result of BLAST Download

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