| RefSeq | NC_006130 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DoriC accession number | pORI00000002 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC length | 1089 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC AT content | 0.6492 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The location of oriC region | 2597..334 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| OriC sequences |
TTTGATACCCTTTCTAAATATTGACGACTACGATATATTAGTTGCTTTTAATTTGTTTGATAACTGTGATTTTCTATTTTAACTCCTTTCTATCTCAAACAAATTGTTTCCGCTTTCATTTTATGATATTTTATTTAGAAATTCAATAGCATTATAGGCTTTTAATTAAAAAATAACGGATTATTTTAACTTACATTGTATAATCATTAACTTAAGTAAAGATAGATTTTATTTCAGGCAAGCAACGGGTTTGTCATGACAAACCCAAAAACGTTGTTTTTGTCTTGTTAGGATTCTCCTAAAACCGTAATAAAAAAGATCAGCATTCGTTTAAAAATGCCGGTCTTTTTTTAATGTCATTATATTCGATTTTTTTACTCACTAGCGTTCGTATGATTCTATTTTGTTGTTGGAATAATTTCCAACAACAAAATAGAATAGCAATCATTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTTAGGCACCCTAACAAGTCGTTTAAGCGATTTGTGTATACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTAAAATGGCTTAGAAGGCAAATATGAGCCTTCTAAGAGGTTTTAGATATAAGCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCGGAGGCGGTTTGGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGACAAAGCAAGTATCACCGTCCCTGGTTTCTTGTTGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGGTATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGATGGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAATTTAACCTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAACACCTAGGTTGCCCCCTAGGTGTTTTCTTTATGCTTATATTTCTTGAACTTTTAAGCATCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAAGGTGTCAAAAAACTGCTTTTTGCTT
TTTGATACCCTTTCTAAATATTGACGACTACGATATATTAGTTGCTTTTAATTTGTTTGATAACTGTGATTTTCTATTTTAACTCCTTTCTATCTCAAACAAATTGTTTCCGCTTTCATTTTATGATATTTTATTTAGAAATTCAATAGCATTATAGGCTTTTAATTAAAAAATAACGGATTATTTTAACTTACATTGTATAATCATTAACTTAAGTAAAGATAGATTTTATTTCAGGCAAGCAACGGGTTTGTCATGACAAACCCAAAAACGTTGTTTTTGTCTTGTTAGGATTCTCCTAAAACCGTAATAAAAAAGATCAGCATTCGTTTAAAAATGCCGGTCTTTTTTTAATGTCATTATATTCGATTTTTTTACTCACTAGCGTTCGTATGATTCTATTTTGTTGTTGGAATAATTTCCAACAACAAAATAGAATAGCAATCATTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTTAGGCACCCTAACAAGTCGTTTAAGCGATTTGTGTATACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTAAAATGGCTTAGAAGGCAAATATGAGCCTTCTAAGAGGTTTTAGATATAAGCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCGGAGGCGGTTTGGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGACAAAGCAAGTATCACCGTCCCTGGTTTCTTGTTGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGGTATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGATGGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAATTTAACCTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAACACCTAGGTTGCCCCCTAGGTGTTTTCTTTATGCTTATATTTCTTGAACTTTTAAGCATCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAAGGTGTCAAAAAACTGCTTTTTGCTT
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The information of repeat sequences |
Motif AGMWCYTTGWBSRWVHGMMVKRMMAASVHMKWVKTWSCSBMSBHGGTKT
Motif SBCAAAMAAVTKGTTTDTG
Motif GCGACAAA
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The result of BLAST |
Download
|