RefSeq NC_022077
DoriC accession number pORI00000217
OriC length 1239 nt
OriC AT content 0.6303
The location of oriC region 1209..2447 nt
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OriC map
OriC sequences
AAAATATCTCCTGATAATCTAAAGGTATTGAAAGTGTATGTTGAGGAATTTTATAGTTTCTATTTTCTCCTTTCTAGTTAAATTTTTGAATGCGCTTTCATTTTATCATTAAAAATATTTTTTGTCAAAACATTTTTAGGATTTCATTAAAATTTTAAAATTATTTCAGGCAGGCAACGGGTTTGTGTACACAAACCCCAAAAAACAGTGTTTTTGTCTTGTTGGGATTCTCCTAAAACCATAATAAAAAAGATCAGTATTATTTAAAAATGCTGGTCTTTTTTTAATGTCATTGCATTCGATTTTTTACTCACTAGTATTCGTATGATTTTATTTTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTCAGGCACTCTAATAAGCCGTTTAAGCGATTTGTCCGCACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTGAAATGCCTTAAAACGCAAATATGAGCCTTCTGAGAGGTTTTAGAGATAATCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCTGGGGCGGTTTTGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGGCAAAGCAAGTATCGCCGTCCCTGGTTTCTTGTCGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGATATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGACAGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAACTTAACTTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAAATACCTAGGTTGCCCCCTAGGTATTTTCTTTATGCTTATATTTCCTGAACTTTTAAGCACCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAATGTGTCAAAAATTGGGTTGGTTGGAGGAATTTTGAGGGGGTTTTTCGTTAGAAAAATCCAGAATATGGGGGGCTACTACGACCCCCCATATAGTGCCGAGTGCCAAATTCGAAAAAAAAGTGGGTTGAAGCTTAGAGCCTCAAGCGTTTGAGGGGTGTTAAACCTCGGCGACTTTTCGGCGACTTTTTAGCGACTTTTTGATAATTTTTTAGAAATAGTACGAAGAAAGTTGCATTTAATGCGTAGTTTTGCTAATATGAACTTATAAAATTTTGAGAGGTGACTT
AAAATATCTCCTGATAATCTAAAGGTATTGAAAGTGTATGTTGAGGAATTTTATAGTTTCTATTTTCTCCTTTCTAGTTAAATTTTTGAATGCGCTTTCATTTTATCATTAAAAATATTTTTTGTCAAAACATTTTTAGGATTTCATTAAAATTTTAAAATTATTTCAGGCAGGCAACGGGTTTGTGTACACAAACCCCAAAAAACAGTGTTTTTGTCTTGTTGGGATTCTCCTAAAACCATAATAAAAAAGATCAGTATTATTTAAAAATGCTGGTCTTTTTTTAATGTCATTGCATTCGATTTTTTACTCACTAGTATTCGTATGATTTTATTTTTAGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGATGACATCATCTGAATAAGGTTTCAGGCACTCTAATAAGCCGTTTAAGCGATTTGTCCGCACAAATCCGTTGCTTGCCTGAATCAGATTGTGAAATGCCTTAAAACGCAAATATGAGCCTTCTGAGAGGTTTTAGAGATAATCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATAAGCAGGGACAAGGTAGACTTAGCTGGGGCGGTTTTGTCAGAACTTTGTTCGACCGACCGGCAAAGCAAGTATCGCCGTCCCTGGTTTCTTGTCGTCAAGGAGACCATGGAATAAAGTAAGCGTGCATGATATAATAACCAAGTCGCATTCACTAAACAGCGAAAGTTGGGAGGTGAAACTTTATGCTAAAAGTATTTCTTGAACTTGTTTTGCTACCGCTGACAGTCAGTGTAGTTGCAGAACTAATTGCGGAATGGTTAATCCGTATGTGGCAAAACAAAGGCGACAAATAACTTAACTTGAGCACCTTGAGCAAGTGCAATAAAAAATACCTAGGTTGCCCCCTAGGTATTTTCTTTATGCTTATATTTCCTGAACTTTTAAGCACCTTCATTGTATCACGTGTGAGATAATGTGTCAAAAATTGGGTTGGTTGGAGGAATTTTGAGGGGGTTTTTCGTTAGAAAAATCCAGAATATGGGGGGCTACTACGACCCCCCATATAGTGCCGAGTGCCAAATTCGAAAAAAAAGTGGGTTGAAGCTTAGAGCCTCAAGCGTTTGAGGGGTGTTAAACCTCGGCGACTTTTCGGCGACTTTTTAGCGACTTTTTGATAATTTTTTAGAAATAGTACGAAGAAAGTTGCATTTAATGCGTAGTTTTGCTAATATGAACTTATAAAATTTTGAGAGGTGACTT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif RGCGAC

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11317.17e-05GCGACTTTTCGGCGACTTTTTAGCGA
11207.17e-05GTTAAACCTCGGCGACTTTTCGGCGA
8227.17e-05GCAAAACAAAGGCGACAAATAACTTA
11421.75e-04GCGACTTTTTAGCGACTTTTTGATAA
3491.75e-04AGTCGAGCGTAGCGACAAATTCAGAT

Motif AAGSGRTTTDTSBNBASAAANCYC

StartP-valueSite
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1761.14e-11TCAGGCAGGCAACGGGTTTGTGTACACAAACCCCAAAAAACAGT
5071.15e-10GAGATAATCTAAGCGATTTATGCCGTGAAAGCTCCTTGACGATA
9881.33e-09AGGAATTTTGAGGGGGTTTTTCGTTAGAAAAATCCAGAATATGG

Motif CGACCSMCC

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10321.91e-07GGGGCTACTACGACCCCCCATATAGTGCC
5901.23e-06GAACTTTGTTCGACCGACCGGCAAAGCAA
The result of BLAST Download

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