DoriC

RefSeq

NC_014557

DoriC accession number

pORI00000488

OriC length

6895 nt

OriC AT content

0.6727

The location of oriC region

9649..16543 nt

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OriC map

OriC sequences

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AT-rich region

The information of repeat sequences

Motif GATATACTAAAAGTGTTCAAWDAATMTATTGATAATCTAAGTCCCCY

Start	P-value		Site
6808	3.48e-25	TTAAAATTAT	GACATACTAAAAGTGTTCAAAAAATATATTGATAATCTAAGTCCCCC	AAGTAGTCTT
6720	1.29e-24	TTAAAATTAT	GATATACTAAAAGTGTTCAAAAAATATATTGATAATCTAAGTCCCCT	AGTAGTCTTT
6631	2.04e-23	TCTAATTTAG	ACTATACTAAAAGTGTCCAATTAATCTATTGATAATCTAAGTCCCCT	TAGTAGTCTT
4737	1.15e-19	CTAGCAAAGC	GATATTTTTTAAGTGTTCGATGTACCCATAGGAAAGCTAGGCACCGC	CTAGCCCCCT

Motif TGGWCGKCVADCAAYKGGTTTGWCAARAMAARYYBC

Start	P-value		Site
1932	4.13e-18	ATCCATACAA	TGTACGGCAAGCAACGGGTTTGTCATGACAAACCCC	AAAACTAAAG
2853	8.83e-17	CTGATATATT	TAGAGGGCAAGCAACGGGTTTGTCCGGACAAACCCC	AAAAACGATG
1349	5.01e-16	TTGGAAAAGT	TGGACGTCCAACAATTGGTCTGACAAAAAAAGTTTC	TCTCACGTTG
4014	2.26e-15	AAAAACCTGT	TGGTCGTCCGTCTATTGGTGTGACAAAAAAAGTTTC	AGTTACGTTG
2554	8.95e-14	GCATTGTTCG	TTCTCGCAGCTCACCTTGTTTCCCAAAGAAAATCGC	ACGTGCTAAA

Motif TRGGAGTVGCKWSAKRAAAAWGCGGAWKKVMRWCGWTMAGCATTT

Start	P-value		Site
4072	4.67e-20	TCAATCTGAT	TGGGATTGGTTAGATGAAAAAGCGGAAGGCAATCGTTCGGCATTT	ATTCGTGAGG
5043	7.45e-20	ATTTCCCCAC	TAGGGGTAGCGTCAGGAAAATGCGGATTTACGACGATAAGCATTT	TGATACAATG
2270	1.46e-18	CTTCTGATTA	TAGGAGTCCCGTCAGAAAAATGCGGATTTACAACGTTAAGGAATT	CGTAAGGGTC
1407	2.50e-18	AAAAGAAGAT	TGGGAATGGCTTGATGAGAAAGCAGAAGGCAATCGATCACAATTT	TTAAGAGAAA
4132	1.40e-15	TGAGGTGCTT	TGGAAGTCGCTAGGGAATGAATCGGAATGGAGCAATTATGCTTGC	TTAGGCTACG

The result of BLAST

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